RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 CXorf40BQ96DE9 158 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 RTP4Q96DX8 246 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 TEKT5Q96M29 485 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 APOL2Q9BQE5 337 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 TIMM29Q9BSF4 260 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 FICDQ9BVA6 458 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 FSD1LQ9BXM9 530 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 UGT1A7Q9HAW7 530 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 UGT1A10Q9HAW8 530 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 UGT1A8Q9HAW9 530 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRIM39Q9HCM9 518 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAD18Q9NS91 495 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCND1Q9NSA2 647 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 OGFRQ9NZT2 677 aa7.06□□□□□ -1.28
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CCNDBP1-212ENST00000567690 IL17BQ9UHF5 180 aa7.06□□□□□ -1.28
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CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPTA1P02549 2419 aa7.06□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
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CCNDBP1-212ENST00000567690 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa7.05□□□□□ -1.28
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CCNDBP1-212ENST00000567690 CHUKO15111 745 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 NKX2-8O15522 239 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 VEGFDO43915 354 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPFIA2O75334 1257 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBXN7O94888 489 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 ITGB2P05107 769 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 BRAFP15056 766 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF28P17035 718 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 IDSP22304 550 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 SPAM1P38567 509 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTSCP53634 463 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP1CAP62136 330 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCZ1BP86790 482 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 MC2RQ01718 297 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 SQSTM1Q13501 440 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLCL1Q15111 1095 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 CHRNA6Q15825 494 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC14A2Q15849 920 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 COLEC12Q5KU26 742 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.05□□□□□ -1.28
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CCNDBP1-212ENST00000567690 BORAQ6PGQ7 559 aa7.05□□□□□ -1.28
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CCNDBP1-212ENST00000567690 DAAM2Q86T65 1068 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLXDC1Q8IUK5 500 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 NLGN4XQ8N0W4 816 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
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CCNDBP1-212ENST00000567690 TC2NQ8N9U0 490 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTC25Q96NG3 672 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 ULBP3Q9BZM4 244 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL26Q9NPH9 171 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDP2Q9P2J9 529 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 INTUQ9ULD6 942 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 WDR37Q9Y2I8 494 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 KCTD3Q9Y597 815 aa7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 RCCD1A6NED2 376 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRR19A6NJB7 356 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCL22O00626 93 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 STX7O15400 261 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIAA0754O94854 1291 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 AGTP01019 485 aa7.04□□□□□ -1.28
CCNDBP1-212ENST00000567690 TUBB4AP04350 444 aa7.04□□□□□ -1.28
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