RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556170.5

NEK9-209, Transcript of NIMA related kinase 9, humanhuman

TSL 5

Gene NEK9, Length 3,975 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9-209ENST00000556170 BBS2Q9BXC9 721 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 SPASTQ9UBP0 616 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 GNPTGQ9UJJ9 305 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ILVBLA1L0T0 632 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ZNF197O14709 1029 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 RGS14O43566 566 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 KERAO60938 352 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 STC2O76061 302 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ANXA5P08758 320 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 DSC3Q14574 896 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ZNF423Q2M1K9 1284 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 BHLHA9Q7RTU4 235 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 CMTM8Q8IZV2 173 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 DYTNA2CJ06 578 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 DNAJB13P59910 316 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 SLC2A7Q6PXP3 512 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 SPESP1Q6UW49 350 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 CCDC81Q6ZN84 652 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 TTC30BQ8N4P2 665 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ZNF366Q8N895 744 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 SLC39A13Q96H72 371 aa14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 OR2AG2A6NM03 316 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 UROSP10746 265 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 S100A3P33764 101 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 SMARCB1Q12824 385 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 SEMA3AQ14563 771 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 PIGGQ5H8A4 983 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ZNF555Q8NEP9 628 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 KIAA1191Q96A73 305 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 LRRC58Q96CX6 371 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 C9orf16Q9BUW7 83 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 GSTO2Q9H4Y5 243 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 NDUFA13Q9P0J0 144 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 MTA1Q13330 715 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 GTF2H2Q13888 395 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 NADSYN1Q6IA69 706 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 TXNDC11Q6PKC3 985 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ELMO1Q92556 727 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 OR52E6Q96RD3 313 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ZNF195O14628 629 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 CCL16O15467 120 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 PTGER3P43115 390 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 CENPFP49454 3210 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 XIAPP98170 497 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 IRF8Q02556 426 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 CACNG1Q06432 222 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 MGAT3Q09327 533 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 SYTL1Q8IYJ3 562 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 KLHL32Q96NJ5 620 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 BTBD9Q96Q07 612 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ABCB8Q9NUT2 735 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 COMMD8Q9NX08 183 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 VPS51Q9UID3 782 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.67□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 LCHNA4D1U4 455 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 HS6ST1O60243 411 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 TBC1D4O60343 1298 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 WDR47O94967 919 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ESR1P03372 595 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 OR56A5P0C7T3 313 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 HTRA3P83110 453 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 RHDQ02161 417 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 HERC3Q15034 1050 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 TGFBIQ15582 683 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 USP45Q70EL2 814 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ADCK2Q7Z695 626 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 APOLD1Q96LR9 279 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 FOPNLQ96NB1 174 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 FFAR2O15552 330 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 KDELR3O43731 214 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 CXCL14O95715 111 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 EPOP01588 193 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 SBK3P0C264 359 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 CHRNA6Q15825 494 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 ZNF284Q2VY69 593 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.66□□□□□ -0.06
NEK9-209ENST00000556170 PGM2L1Q6PCE3 622 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms