RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	RUFY1	Q96T51	708 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	MAGEE1	Q9HCI5	957 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	KCND3	Q9UK17	655 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		12.36	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	CDK14	O94921	469 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	MBD3	O95983	291 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	KDELR1	P24390	212 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	IRGC	Q6NXR0	463 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	ATCAY	Q86WG3	371 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	PPP1R3B	Q86XI6	285 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	GPR150	Q8NGU9	434 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	TADA1	Q96BN2	335 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	AGAP3	Q96P47	875 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	LHX9	Q9NQ69	397 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	PADI1	Q9ULC6	663 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		12.35	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	SNRNP200	O75643	2136 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	PIPSL	A2A3N6	862 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	VEGFD	O43915	354 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	CCNYL3	P0C7X3	344 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	FOLR1	P15328	257 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	IDS	P22304	550 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	CASP14	P31944	242 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	ZBED6	P86452	979 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	CDK18	Q07002	472 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	AP1B1	Q10567	949 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNAB1	Q14722	419 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	NPNT	Q6UXI9	565 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	NT5DC3	Q86UY8	548 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	CXorf40B	Q96DE9	158 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	VPS35	Q96QK1	796 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	RAB33B	Q9H082	229 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	ACTL8	Q9H568	366 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	RAD18	Q9NS91	495 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	LRBA	P50851	2863 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	PCSK5	Q92824	1860 aa		12.34	□□□□□ -0.43
LETMD1-231	ENST00000551931	LRRD1	A4D1F6	860 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	GPR39	O43194	453 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	MT-ND3	P03897	115 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	GYPC	P04921	128 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	EBLN1	P0CF75	366 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	CA5A	P35218	305 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	FANCC	Q00597	558 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	TUBB3	Q13509	450 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	SEMA5A	Q13591	1074 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	NOMO1	Q15155	1222 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	CPZ	Q66K79	652 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM199X	Q6PEV8	388 aa	Predicted RBP	12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	OLFM3	Q96PB7	478 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		12.33	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	C21orf140	B9A014	251 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	PMPCB	O75439	489 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	NDST3	O95803	873 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	RECK	O95980	971 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	GNLY	P22749	145 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	FECH	P22830	423 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	CTSC	P53634	463 aa		12.32	□□□□□ -0.44
LETMD1-231	ENST00000551931	CHAF1B	Q13112	559 aa		12.32	□□□□□ -0.44

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