RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CISHQ9NSE2 258 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SCN3BQ9NY72 215 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 RAB26Q9ULW5 256 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 H0Y858 1186 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PEX11AO75192 247 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PALMO75781 387 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SOAT2O75908 522 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 UBE2E3Q969T4 207 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 TAGLN3Q9UI15 199 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.26□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 RNF151Q2KHN1 245 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 UBA3Q8TBC4 463 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 KCNN1Q92952 543 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 MCEEQ96PE7 176 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 KCNN2Q9H2S1 579 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 PIF1Q9H611 641 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 UGT1A9O60656 530 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 STX11O75558 287 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 POLBP06746 335 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 CD63P08962 238 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 UGT1A1P22309 533 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 UGT1A4P22310 534 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 UGT1A5P35504 534 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 LPCAT1Q8NF37 534 aa6.25□□□□□ -1.41
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PTPRB-210ENST00000551525 Q96MT0 163 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 QRFPRQ96P65 431 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CTRCQ99895 268 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 ACBD6Q9BR61 282 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 CDT1Q9H211 546 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 GANQ9H2C0 597 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 UGT1A7Q9HAW7 530 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 UGT1A10Q9HAW8 530 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 UGT1A8Q9HAW9 530 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 GPAMQ9HCL2 828 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PTPRB-210ENST00000551525 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.25□□□□□ -1.41
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