RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	GPR26	Q8NDV2	337 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	SNX7	Q9UNH6	387 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		11.89	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	SVIL	O95425	2214 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	PRSS44	E7EML9	344 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	MEN1	O00255	615 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	JCHAIN	P01591	159 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	PSMA2	P25787	234 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	FOXL2	P58012	376 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	LLGL1	Q15334	1064 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	QPCT	Q16769	361 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	MARC1	Q5VT66	337 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	DCUN1D2	Q6PH85	259 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	MED25	Q71SY5	747 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	POLN	Q7Z5Q5	900 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	HPS6	Q86YV9	775 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	UBXN4	Q92575	508 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	LURAP1	Q96LR2	239 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	LYSMD1	Q96S90	227 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	NLN	Q9BYT8	704 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	KCND1	Q9NSA2	647 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	POT1	Q9NUX5	634 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	C5AR2	Q9P296	337 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	ITGB1BP2	Q9UKP3	347 aa		11.88	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	DNHD1	Q96M86	4753 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	RAB40AL	P0C0E4	278 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	GLRB	P48167	497 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	ACY1	Q03154	408 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	TESK1	Q15569	626 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	INSC	Q1MX18	579 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	PTCHD3	Q3KNS1	767 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	ALS2CL	Q60I27	953 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557		Q6ZS92	163 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	AVL9	Q8NBF6	648 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	AGPAT1	Q99943	283 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		11.87	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	C1orf232	A0A0U1RR37	186 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	ANKRD62	A6NC57	917 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	KLF7	O75840	302 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	MMP2	P08253	660 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	FECH	P22830	423 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	EPHB1	P54762	984 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	KRTAP10-9	P60411	292 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	TUBB4B	P68371	445 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	PDE1B	Q01064	536 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	ITK	Q08881	620 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	TUBB2A	Q13885	445 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	KYNU	Q16719	465 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	PLEKHA7	Q6IQ23	1121 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	FAM83H	Q6ZRV2	1179 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	MLKL	Q8NB16	471 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	POM121	Q96HA1	1249 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	LRFN5	Q96NI6	719 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		11.86	□□□□□ -0.51
BBS1-222	ENST00000533557	NRTN	Q99748	197 aa		11.86	□□□□□ -0.51

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