RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527644.1

TSPAN4-217, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 968 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-217ENST00000527644 C19orf48Q6RUI8 117 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 AMZ2Q86W34 360 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF248Q8NDW4 579 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 OR4D9Q8NGE8 314 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 ULK4Q96C45 1275 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CMKLR1Q99788 373 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 PAK5Q9P286 719 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CRLS1Q9UJA2 301 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 LOXL2Q9Y4K0 774 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa25.93■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 SUN1O94901 812 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 ETS1P14921 441 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 ITGALP20701 1170 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 LMAN1P49257 510 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 LIMK2P53671 638 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 EPHA4P54764 986 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 DMPKQ09013 629 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CDH17Q12864 832 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 POU6F1Q14863 301 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 SNX20Q7Z614 316 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 STYXQ8WUJ0 223 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 JRKLQ9Y4A0 524 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa25.92■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 OR2AG2A6NM03 316 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 E7EVH7 732 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 H7C0S8 307 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 DUX1O43812 170 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 JMJD7P0C870 316 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 RPL10P27635 214 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CXCR5P32302 372 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 ABCG1P45844 678 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CFHR1Q03591 330 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 SEMA5AQ13591 1074 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 GPR33Q49SQ1 333 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 TMEM71Q6P5X7 295 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CLEC14AQ86T13 490 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 DNAAF3Q8N9W5 541 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 OR52K1Q8NGK4 314 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 HEXDCQ8WVB3 486 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 UCK1Q9HA47 277 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 RAB6BQ9NRW1 208 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 HOMER3Q9NSC5 361 aa25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 BPTFQ12830 3046 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 HGSO14964 777 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 GAS8O95995 478 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 VIPP01282 170 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 RALBP11234 206 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 HGFP14210 728 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 BRAFP15056 766 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 MC4RP32245 332 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CSF2RBP32927 897 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 SLC19A1P41440 591 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 SEPT6Q14141 434 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 COL28A1Q2UY09 1125 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 FNBP1LQ5T0N5 605 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 C4orf22Q6V702 233 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 PRUNE1Q86TP1 453 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 TRIM48Q8IWZ4 208 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 NXPE1Q8N323 547 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 GLIS1Q8NBF1 620 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 SGF29Q96ES7 293 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 DCUN1D1Q96GG9 259 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 EPB41L1Q9H4G0 881 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 LHX6Q9UPM6 363 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 ZFHX4Q86UP3 3567 aa25.9■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 ADAMTS20P59510 1910 aa25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 KLHL33A6NCF5 533 aa25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 MROH6A6NGR9 719 aa25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 LILRA5A6NI73 299 aa25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CCL22O00626 93 aa25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 ZSCAN12O43309 604 aa25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 ITPKBP27987 946 aa25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 RPL22P35268 128 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 DRG2P55039 364 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC173Q0VFZ6 552 aa25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 LAMB3Q13751 1172 aa25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 C16orf72Q14CZ0 275 aa25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 DET1Q7L5Y6 550 aa25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa25.89■■□□□ 1.74
TSPAN4-217ENST00000527644 CCDC74BQ96LY2 380 aa25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms