RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522344.1

CPEB4-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB4, Length 481 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB4-210ENST00000522344 UNC45AQ9H3U1 944 aa3.98□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 SH2D4AQ9H788 454 aa3.98□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 SLC38A7Q9NVC3 462 aa3.98□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 A0A0G2JNG1 304 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 LIPT2A6NK58 231 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 DUXAA6NLW8 204 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 B4E171 279 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 CLIC2O15247 247 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 OGG1O15527 345 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 PCDH7O60245 1069 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 WISP2O76076 250 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 MBD4O95243 580 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 CD4P01730 458 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 SERPINB2P05120 415 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 HRH2P25021 359 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 CHRNB4P30926 498 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 ARL3P36405 182 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 TSPAN7P41732 249 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 MSH2P43246 934 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 CTSCP53634 463 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 UBE2V1Q13404 147 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 KIR2DS5Q14953 304 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM198Q66K66 360 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 PACS1Q6VY07 963 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 Q75L30 129 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 GCSAMQ8N6F7 178 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 SLC38A9Q8NBW4 561 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF248Q8NDW4 579 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 FAM76AQ8TAV0 307 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 TAS1R2Q8TE23 839 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 POMGNT1Q8WZA1 660 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 BARHL1Q9BZE3 327 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 KRT84Q9NSB2 600 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 SETD4Q9NVD3 440 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa3.97□□□□□ -1.77
CPEB4-210ENST00000522344 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 A0A1W2PPI3 338 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 C15orf62A8K5M9 175 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 J3QR06 171 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 ZNF217O75362 1048 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 PATE4P0C8F1 98 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 GNAZP19086 355 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 CHMP24386 653 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 ALDH4A1P30038 563 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 MAN1A1P33908 653 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 HSD17B4P51659 736 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 ERVK11-1P61568 191 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 KIR2DS3Q14952 304 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 MEP1AQ16819 746 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 DUOXA1Q1HG43 343 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 TMEM30BQ3MIR4 351 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 TECRLQ5HYJ1 363 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 KLHL35Q6PF15 583 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 IKBIPQ70UQ0 350 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 TEX11Q8IYF3 940 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 TMTC2Q8N394 836 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 WDSUB1Q8N9V3 476 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 FCAMRQ8WWV6 532 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 C17orf77Q96MU5 243 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 CMTM3Q96MX0 182 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 PLK3Q9H4B4 646 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 RAD21L1Q9H4I0 556 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 KAT14Q9H8E8 782 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 SLC52A3Q9NQ40 469 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 KCNK7Q9Y2U2 307 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 YIPF1Q9Y548 306 aa3.96□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 SMCHD1A6NHR9 2005 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 A0A0G2JLW4 131 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 H0YIN7 160 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 PLK4O00444 970 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 SCAMP1O15126 338 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 MSH3P20585 1137 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 GPR143P51810 404 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 PPP2R2BQ00005 443 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 IKQ13123 557 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 CCDC6Q16204 474 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 C14orf177Q52M58 125 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa3.95□□□□□ -1.78
CPEB4-210ENST00000522344 ARHGAP17Q68EM7 881 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms