RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517215.1

RNU6-1238P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1238, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1238P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RNF130Q86XS8 419 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HIPK1Q86Z02 1210 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF695Q8IW36 515 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF34Q8IZ26 560 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 UBR7Q8N806 425 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 C4orf32Q8N8J7 132 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OR2L8Q8NGY9 312 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OVCA2Q8WZ82 227 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PIGTQ969N2 578 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PPP1R16AQ96I34 528 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DGAT2Q96PD7 388 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HSPB9Q9BQS6 159 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 UBAC1Q9BSL1 405 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ACAD9Q9H845 621 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 EMC7Q9NPA0 242 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 COQ3Q9NZJ6 369 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PKD2L2Q9NZM6 624 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TMEM9Q9P0T7 183 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DNAJB4Q9UDY4 337 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TBX21Q9UL17 535 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MOKQ9UQ07 419 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 POLHQ9Y253 713 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MST1RQ04912 1400 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 USH2AO75445 5202 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KCPQ6ZWJ8 1503 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa-0.85□□□□□ -2.54
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SDK1Q7Z5N4 2213 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 A0A096LPK6 155 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TRAV40A0A0B4J280 105 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 A0A1B0GWB2 263 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 VGLL3A8MV65 326 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PLD2O14939 933 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RAPGEF3O95398 923 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OSMP13725 252 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DRD1P21728 446 aa-0.85□□□□□ -2.55
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 TGFBR2P37173 567 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PIGAP37287 484 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ETFBP38117 255 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PBX1P40424 430 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PIK3CAP42336 1068 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 UQCRFS1P47985 274 aa-0.85□□□□□ -2.55
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 GPR17Q13304 367 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ACVR2BQ13705 512 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CBFBQ13951 182 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RASGRF1Q13972 1273 aa-0.85□□□□□ -2.55
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 FAM120AOSQ5T036 256 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CYP4A22Q5TCH4 519 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LYSMD4Q5XG99 296 aa-0.85□□□□□ -2.55
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LINC01551Q86U37 167 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NOXA1Q86UR1 476 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 WDR5BQ86VZ2 330 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CATSPERDQ86XM0 798 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GID4Q8IVV7 300 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ADSSL1Q8N142 457 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MARVELD2Q8N4S9 558 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC22A8Q8TCC7 542 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LMBR1Q8WVP7 490 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FAR1Q8WVX9 515 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HPSE2Q8WWQ2 592 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 EXOC4Q96A65 974 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GCC1Q96CN9 775 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC47A1Q96FL8 570 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-1238P-201ENST00000517215 APIPQ96GX9 242 aa-0.85□□□□□ -2.55
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