RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512656.1

USP46-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

TSL 3

Gene USP46, Length 467 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-208ENST00000512656 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 NUP85Q9BW27 656 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 ABCG8Q9H221 673 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 CLMPQ9H6B4 373 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 FOXJ2Q9P0K8 574 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 LCMT1Q9UIC8 334 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa7.13□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 LRP4O75096 1905 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 RGSL1A5PLK6 1076 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 SOWAHDA6NJG2 315 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 B4E171 279 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 PPM1DO15297 605 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 DUX1O43812 170 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 FUCA1P04066 466 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 CYP1A2P05177 515 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 KRT7P08729 469 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 CCL4P13236 92 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 TCF4P15884 667 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 CCNCP24863 283 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 GARSP41250 739 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 TSPAN7P41732 249 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 FASLGP48023 281 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 STC1P52823 247 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 ID3Q02535 119 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 GALNT2Q10471 571 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 NFATC3Q12968 1075 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 NR1I3Q14994 352 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 PDK2Q15119 407 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 PYCR3Q53H96 274 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 DCAF12Q5T6F0 453 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 ALG1LQ6GMV1 187 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 TMEM71Q6P5X7 295 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 ATG14Q6ZNE5 492 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 VASH2Q86V25 355 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 NAGSQ8N159 534 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 EXD3Q8N9H8 876 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 AVL9Q8NBF6 648 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 KCTD6Q8NC69 237 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 RCBTB1Q8NDN9 531 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 FAM71BQ8TC56 605 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 CCHCR1Q8TD31 782 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 MAML1Q92585 1016 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 EXTL1Q92935 676 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 SCAMP4Q969E2 229 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 FATE1Q969F0 183 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 MISP3Q96FF7 219 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 TSGA13Q96PP4 275 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 SLC38A3Q99624 504 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 DDA1Q9BW61 102 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 THAP2Q9H0W7 228 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 EPB41L1Q9H4G0 881 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 RMI1Q9H9A7 625 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 VPS18Q9P253 973 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 CD84Q9UIB8 345 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 NBASA2RRP1 2371 aa7.12□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 ANKRD36A6QL64 1941 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 A0A0G2JNG1 304 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 OR5K4A6NMS3 321 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 KIR2DS3K7RE56 304 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 INPP4BO15327 924 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 MFSD11O43934 449 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 PPFIA2O75334 1257 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 PDHA1P08559 390 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 FAM87AP0C7U9 286 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 THRAP10827 490 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 IL4RP24394 825 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 GJC1P36383 396 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 CSRP3P50461 194 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 ZBED6P86452 979 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 FANCCQ00597 558 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 DPYSL3Q14195 570 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 KIR2DS5Q14953 304 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 TBR1Q16650 682 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 LINC00303Q3SY05 128 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa7.11□□□□□ -1.27
USP46-208ENST00000512656 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms