RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	GPATCH2L	Q9NWQ4	482 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CD84	Q9UIB8	345 aa		10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGEF17	Q96PE2	2063 aa	Predicted RBP	10.72	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMD11	O00231	422 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SOCS5	O75159	536 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	RASSF9	O75901	435 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJB5	O75953	348 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	KIAA0754	O94854	1291 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	NDUFA10	O95299	355 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	DDAH2	O95865	285 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF28	P17035	718 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	LHCGR	P22888	699 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	TEAD1	P28347	426 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SEPHS1	P49903	392 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF143	P52747	638 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	FMO1	Q01740	532 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	IL10RB	Q08334	325 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PYCR3	Q53H96	274 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	MAMDC2	Q7Z304	686 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf20	Q8ND61	904 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PSKH2	Q96QS6	385 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6C1	Q96RD1	312 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	CNPY3	Q9BT09	278 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC29A3	Q9BZD2	475 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	VPS16	Q9H269	839 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	EPB41L1	Q9H4G0	881 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SKAP2-209	ENST00000497511	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXO24	O75426	580 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CREG1	O75629	220 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	EML2	O95834	649 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PYGL	P06737	847 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ACP5	P13686	325 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	AMD1	P17707	334 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CTPS1	P17812	591 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	DNASE1L3	Q13609	305 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CAMK4	Q16566	473 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	NADK2	Q4G0N4	442 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ARMC12	Q5T9G4	340 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	AVL9	Q8NBF6	648 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SCAMP4	Q969E2	229 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TGM7	Q96PF1	710 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	HERPUD2	Q9BSE4	406 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC25A23	Q9BV35	468 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D10A	Q9BXI6	508 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ACSS2	Q9NR19	701 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PADI1	Q9ULC6	663 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNK6	Q9Y257	313 aa		10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	10.7	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	LRCH4	O75427	683 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TGFB1	P01137	390 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	MT-ND3	P03897	115 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF224	P0DH78	156 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	TYRP1	P17643	537 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRNB2	P17787	502 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ERCC2	P18074	760 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SOX5	P35711	763 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPA9	P38646	679 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	DCT	P40126	519 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	GARS	P41250	739 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL11	P51671	97 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	EPHB1	P54762	984 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	GFER	P55789	205 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	DPT	Q07507	201 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA5A	Q13591	1074 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	IL11RA	Q14626	422 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	MIIP	Q5JXC2	388 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	IYD	Q6PHW0	289 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	RFX8	Q6ZV50	586 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	ZAR1	Q86SH2	424 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	MLKL	Q8NB16	471 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	EXD1	Q8NHP7	514 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SKAP2-209	ENST00000497511	SEC14L1	Q92503	715 aa		10.69	□□□□□ -0.7

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