RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 SLC11A2P49281 568 aa6.96□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 OR52E8Q6IFG1 317 aa6.96□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.96□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.96□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa6.96□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 SYT13Q7L8C5 426 aa6.96□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.96□□□□□ -1.29
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HERC4-211ENST00000492996 OR4K2Q8NGD2 314 aa6.96□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 ASB12Q8WXK4 309 aa6.96□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 CDRT15Q96T59 188 aa6.96□□□□□ -1.29
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HERC4-211ENST00000492996 FAM192AQ9GZU8 254 aa6.96□□□□□ -1.29
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HERC4-211ENST00000492996 MUC3BQ9H195 1237 aa6.96□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
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HERC4-211ENST00000492996 MUTYHQ9UIF7 546 aa6.96□□□□□ -1.29
HERC4-211ENST00000492996 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 MROH6A6NGR9 719 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 F8W8V4 182 aa6.96□□□□□ -1.3
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HERC4-211ENST00000492996 RHOCP08134 193 aa6.96□□□□□ -1.3
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HERC4-211ENST00000492996 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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HERC4-211ENST00000492996 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 HECTD3Q5T447 861 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 GK5Q6ZS86 529 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 FAM156AQ8NDB6 213 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 GAB3Q8WWW8 586 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PTERQ96BW5 349 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 MFSD1Q9H3U5 465 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa6.96□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 RGSL1A5PLK6 1076 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ZNF840PA6NDX5 716 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 SDHDO14521 159 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 GPR39O43194 453 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 THRAP10827 490 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 MAPKAPK2P49137 400 aa6.95□□□□□ -1.3
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CCNIQ14094 377 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PFKFB4Q16877 469 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 LPCAT4Q643R3 524 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 LAYNQ6UX15 382 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CUZD1Q86UP6 607 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 DSELQ8IZU8 1212 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 BBS5Q8N3I7 341 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 KYQ8NBH2 561 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 OR6K2Q8NGY2 324 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 OR4L1Q8NH43 312 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 GIMAP2Q9UG22 337 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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HERC4-211ENST00000492996 GPC4O75487 556 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 STC2O76061 302 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 NDST3O95803 873 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 FGF1P05230 155 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 RBP1P09455 135 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ACADSP16219 412 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 EPCAMP16422 314 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 HLA-DPA1P20036 260 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 THOP1P52888 689 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 BTKQ06187 659 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 ART3Q13508 389 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC4-211ENST00000492996 MPP7Q5T2T1 576 aa6.95□□□□□ -1.3
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