RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490575.1

PTPRVP-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRVP, Length 953 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-202ENST00000490575 FNBP1LQ5T0N5 605 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 CES3Q6UWW8 571 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 SNX20Q7Z614 316 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 SERPINA9Q86WD7 417 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 NXPE1Q8N323 547 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 HDAC10Q969S8 669 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 RANBP9Q96S59 729 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 C19orf43Q9BQ61 176 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 FOXP3Q9BZS1 431 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 SYBUQ9NX95 663 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 TMEM9Q9P0T7 183 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 CRLS1Q9UJA2 301 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 TCAF1Q9Y4C2 921 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 OR52A4PA6NMU1 304 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 D6RAR5 112 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 GOT2P00505 430 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 F3P13726 295 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 TPSB2P20231 275 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 ADRA1DP25100 572 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 MSNP26038 577 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 ACRV1P26436 265 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 NMBRP28336 390 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 ALDH4A1P30038 563 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 CSF2RBP32927 897 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 HADHAP40939 763 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC19A1P41440 591 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 MAGEA6P43360 314 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 PDE1BQ01064 536 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 TPSAB1Q15661 275 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 USP53Q70EK8 1073 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 CLDN19Q8N6F1 224 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 NUDT22Q9BRQ3 303 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 TIMM29Q9BSF4 260 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 FAM8A1Q9UBU6 413 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 PSMD13Q9UNM6 376 aa16■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 ZZEF1O43149 2961 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 MPOP05164 745 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 PNLIPP16233 465 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 TCP1P17987 556 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 MSH3P20585 1137 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 ARNTP27540 789 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 AKT1P31749 480 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 FASLGP48023 281 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 SPIDRQ14159 915 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 AMZ1Q400G9 498 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 OR6C4Q8NGE1 309 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 SEMA6CQ9H3T2 930 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 TREX1Q9NSU2 369 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 EVA1BQ9NVM1 165 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 USP24Q9UPU5 2620 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 HEATR9A2RTY3 570 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 RHPN2P1A8MT19 583 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 GOLGA8MH3BSY2 632 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 OR1I1O60431 355 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 F7P08709 466 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 ITGALP20701 1170 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 MPSTP25325 297 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 IVDP26440 423 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 CACNG1Q06432 222 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 DMPKQ09013 629 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 GTF2H3Q13889 308 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 BCL7AQ4VC05 210 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 LRRC8BQ6P9F7 803 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 C4orf22Q6V702 233 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 TAS2R42Q7RTR8 314 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 SPNS2Q8IVW8 549 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 SLITRK4Q8IW52 837 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 NAT8LQ8N9F0 302 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 GPR150Q8NGU9 434 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 LRRC45Q96CN5 670 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 MFSD3Q96ES6 412 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 TTC25Q96NG3 672 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 DEPDC7Q96QD5 511 aa15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
PTPRVP-202ENST00000490575 NRTNQ99748 197 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms