RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490476.1

SSX2IP-208, Transcript of SSX family member 2 interacting protein, human

TSL 3

Gene SSX2IP, Length 716 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSX2IP-208	ENST00000490476	LAMA1	P25391	3075 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSX2IP-208	ENST00000490476	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSX2IP-208	ENST00000490476	MCM3AP	O60318	1980 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SSX2IP-208	ENST00000490476	KIR2DS5	A0A0G2JLQ3	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	HSPB6	O14558	160 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	NUDT3	O95989	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	FSHB	P01225	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	RB1	P06400	928 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CDA	P32320	146 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	GABRB2	P47870	512 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	NOVA1	P51513	510 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CFHR1	Q03591	330 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	EPS8	Q12929	822 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ITGAD	Q13349	1161 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	GRB14	Q14449	540 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	EPC2	Q52LR7	807 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SARM1	Q6SZW1	724 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	LCTL	Q6UWM7	567 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	HASPIN	Q8TF76	798 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	RAD9A	Q99638	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	NCAPG	Q9BPX3	1015 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	TKTL2	Q9H0I9	626 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	EBAG9	O00559	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	OR2C1	O95371	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	GJB5	O95377	273 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	TNFSF8	P32971	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	RYK	P34925	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	NNMT	P40261	264 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	UBA7	P41226	1012 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	PIK3CA	P42336	1068 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	GDF5	P43026	501 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	GPR12	P47775	334 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CENPA	P49450	140 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CSRP3	P50461	194 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	GALC	P54803	685 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	HMGCS2	P54868	508 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	PROK1	P58294	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	DPT	Q07507	201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	PKP1	Q13835	747 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	KIAA1614	Q5VZ46	1190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	TMC8	Q8IU68	726 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	GABPB2	Q8TAK5	448 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CEP76	Q8TAP6	659 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SAT2	Q96F10	170 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CD209	Q9NNX6	404 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	RAB23	Q9ULC3	237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	NENF	Q9UMX5	172 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	CACNA1E	Q15878	2313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSX2IP-208	ENST00000490476	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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