RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 NEUROD6Q96NK8 337 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 PLK3Q9H4B4 646 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 SETD4Q9NVD3 440 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 PRR23AA6NEV1 266 aa5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 KCNK5O95279 499 aa5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 OR2C1O95371 312 aa5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 RUNX1T1Q06455 604 aa5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 PACS1Q6VY07 963 aa5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 CFAP77Q6ZQR2 320 aa5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 CHST9Q7L1S5 443 aa5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 GALNT5Q7Z7M9 940 aa5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 FBXO17Q96EF6 278 aa5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 SMC6Q96SB8 1091 aa5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 RAD21L1Q9H4I0 556 aa5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 SYNCQ9H7C4 482 aa5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 A0A1W2PPI3 338 aa5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 SOCS5O75159 536 aa5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 GH2P01242 217 aa5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 RB1P06400 928 aa5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 MCCP23508 829 aa5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 HRH2P25021 359 aa5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 TM4SF1P30408 202 aa5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 KIR2DS3Q14952 304 aa5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 MEP1AQ16819 746 aa5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 PLA2G4FQ68DD2 849 aa5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 ATG9AQ7Z3C6 839 aa5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 LONP2Q86WA8 852 aa5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 TTC39CQ8N584 583 aa5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 PGLYRP2Q96PD5 576 aa5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 FBXL17Q9UF56 701 aa5.68□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 A0A0G2JNG1 304 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 TMEM8BA6NDV4 472 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 CTSVO60911 334 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 ZNF217O75362 1048 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 PTP4A3O75365 173 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 BMP10O95393 424 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 BAG4O95429 457 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 TFAP2AP05549 437 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 CLTBP09497 229 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 CAPN3P20807 821 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 PON1P27169 355 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 PSMB10P40306 273 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 NR2C2P49116 596 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 KIR2DS5Q14953 304 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 DUOXA1Q1HG43 343 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 RAB6CQ53S08 254 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 SLC35E4Q6ICL7 350 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 RAD9BQ6WBX8 426 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 GBGT1Q8N5D6 347 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 CNBD1Q8NA66 436 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 RAB6CQ9H0N0 254 aa5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 PRSS47A8MTI9 375 aa5.66□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 PTGES3LE9PB15 166 aa5.66□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 TMEM178BH3BS89 294 aa5.66□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 J3QR06 171 aa5.66□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 AP3D1O14617 1153 aa5.66□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 PLPP2O43688 288 aa5.66□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 SH3BP5O60239 455 aa5.66□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 GABRB1P18505 474 aa5.66□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 TIMP3P35625 211 aa5.66□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 ZNF534Q76KX8 674 aa5.66□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 SMPDL3BQ92485 455 aa5.66□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 GAD1Q99259 594 aa5.66□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 GFI1Q99684 422 aa5.66□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 KLHL9Q9P2J3 617 aa5.66□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 PCDH7O60245 1069 aa5.65□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 TPPPO94811 219 aa5.65□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 PLGP00747 810 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 INHBAP08476 426 aa5.65□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 MAPK4P31152 587 aa5.65□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 DRG2P55039 364 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 PLXDC2Q6UX71 529 aa5.65□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.6 ms