RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 ACP5P13686 325 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 HSD17B2P37059 387 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CPA2P48052 419 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ALDH9A1P49189 494 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SEMA3BQ13214 749 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 NFYCQ13952 458 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 NAA25Q14CX7 972 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SF1Q15637 639 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PAQR3Q6TCH7 311 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SYT12Q8IV01 421 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 NRSN1Q8IZ57 195 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 BANPQ8N9N5 519 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 LCN9Q8WX39 176 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 HIC2Q96JB3 615 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PKMYT1Q99640 499 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ACAT2Q9BWD1 397 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PCBD2Q9H0N5 130 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RUBCNLQ9H714 662 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 NDOR1Q9UHB4 597 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PSME2Q9UL46 239 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SLC12A4Q9UP95 1085 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FCHO1O14526 889 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 POP7O75817 140 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TNFP01375 233 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 DNAJB1P25685 340 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RGS1Q08116 209 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FASTKQ14296 549 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CYP20A1Q6UW02 462 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CUZD1Q86UP6 607 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CHST14Q8NCH0 376 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 KCNJ9Q92806 393 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 C12orf66Q96MD2 445 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 OSBPL6Q9BZF3 934 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ABCG4Q9H172 646 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM216Q9P0N5 145 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PSMD13Q9UNM6 376 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TRAF6Q9Y4K3 522 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CACNG3O60359 315 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TSPAN8P19075 237 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ITPKAP23677 461 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 IVDP26440 423 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 HPCAL1P37235 193 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ETV3P41162 512 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 DMTNQ08495 405 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TDGQ13569 410 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 LILRA6Q6PI73 481 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 OTOFQ9HC10 1997 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PIPSLA2A3N6 862 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD65E5RJM6 399 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 LAMTOR5O43504 91 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PI15O43692 258 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ADRB3P13945 408 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GALK1P51570 392 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 AP1S2P56377 157 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 LCP2Q13094 533 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF460Q14592 562 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CD300LGQ6UXG3 332 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GLYATL1Q969I3 302 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ELSPBP1Q96BH3 223 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SLC25A23Q9BV35 468 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GSDMCQ9BYG8 508 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ATG10Q9H0Y0 220 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ITM2CQ9NQX7 267 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RIMKLBQ9ULI2 386 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CYP8B1Q9UNU6 501 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 A0A1W2PQU0 124 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RHPN2P1A8MT19 583 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 IGLV3-25P01717 112 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 SERPINB3P29508 390 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 RPL3P39023 403 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 PKNOX1P55347 436 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 CDC16Q13042 620 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 TAF11Q15544 211 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 GRAMD1BQ3KR37 738 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 FUT11Q495W5 492 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRD-211ENST00000486161 LONP2Q86WA8 852 aa8.17□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms