RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483765.5

RPL21-208, Transcript of ribosomal protein L21, human

TSL 3

Gene RPL21, Length 453 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPL21-208	ENST00000483765	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	S1PR1	P21453	382 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	CHM	P24386	653 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	RFC4	P35249	363 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	F2RL1	P55085	397 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ZBED6	P86452	979 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	TROAP	Q12815	778 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	CDON	Q4KMG0	1287 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	RGMB	Q6NW40	437 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	CYP20A1	Q6UW02	462 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	SMIM5	Q71RC9	77 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	C1orf87	Q8N0U7	546 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	PCDH20	Q8N6Y1	951 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	SGCD	Q92629	289 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	HARBI1	Q96MB7	349 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	KLHL1	Q9NR64	748 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ACSS1	Q9NUB1	689 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765		A0A087X0M5	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765		A0A0G2JPF8	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765		A0A1B0GX30	115 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	SPINT2	O43291	252 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	HCRTR2	O43614	444 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	BUB3	O43684	328 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	F7	P08709	466 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	IL7R	P16871	459 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	PAX3	P23760	479 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	MAN1A1	P33908	653 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	USP8	P40818	1118 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	DLX5	P56178	289 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	NLRP5	P59047	1200 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	FOXM1	Q08050	763 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	DECR1	Q16698	335 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	TRNP1	Q6NT89	227 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	NRROS	Q86YC3	692 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	GPC2	Q8N158	579 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	PAF1	Q8N7H5	531 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	FRMD1	Q8N878	549 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	PPHLN1	Q8NEY8	458 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	PIGB	Q92521	554 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	TAAR8	Q969N4	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	LMLN	Q96KR4	655 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	ADAM18	Q9Y3Q7	739 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	PSAT1	Q9Y617	370 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	MAU2	Q9Y6X3	613 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	KIAA0100	Q14667	2235 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	LILRA5	A6NI73	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765		H0YIN7	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	EGF	P01133	1207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RPL21-208	ENST00000483765	LAMP2	P13473	410 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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