RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479043.1

ANKRD28-210, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-210ENST00000479043 OR14L1PQ8NHC6 308 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC44A1Q8WWI5 657 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 FAM149B1Q96BN6 582 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 FBXO17Q96EF6 278 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 SCRN2Q96FV2 425 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 TMEM68Q96MH6 324 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 RAB6CQ9H0N0 254 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 MAGIXQ9H6Y5 334 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF696Q9H7X3 374 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 SLC28A3Q9HAS3 691 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 SCRT2Q9NQ03 307 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 FBXL2Q9UKC9 423 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 KLHL20Q9Y2M5 609 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 CLIC4Q9Y696 253 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 PREX2Q70Z35 1606 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 CLASP1Q7Z460 1538 aa3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 ABCC2Q92887 1545 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 C5orf60A6NFR6 353 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 F5H0A9 414 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 ANKRD28O15084 1053 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 ZG16O60844 167 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 PBX3P40426 434 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 RARSP54136 660 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 DPCR1Q3MIW9 517 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 PDSS1Q5T2R2 415 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 ARHGAP17Q68EM7 881 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 OR7E24Q6IFN5 339 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 SEPT14Q6ZU15 432 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 PXKQ7Z7A4 578 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 CPLX4Q7Z7G2 160 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 GPR180Q86V85 440 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 EPHX4Q8IUS5 362 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 OR52I2Q8NH67 350 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 FAM76AQ8TAV0 307 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF524Q96C55 264 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 ARHGEF26Q96DR7 871 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 HARBI1Q96MB7 349 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 C17orf77Q96MU5 243 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 DUX3Q96PT4 197 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 ITPAQ9BY32 194 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 MAU2Q9Y6X3 613 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 C9orf84Q5VXU9 1444 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 ERCC6L2Q5T890 1561 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 TTC37Q6PGP7 1564 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 MAST1Q9Y2H9 1570 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 ITIH6Q6UXX5 1313 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 CHD1O14646 1710 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 MAGI2Q86UL8 1455 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa3.15□□□□□ -1.9
ANKRD28-210ENST00000479043 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 PI4KAP2A4QPH2 592 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 OR5K3A6NET4 321 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 CCER2I3L3R5 266 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 HS3ST1O14792 307 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 HCRTR2O43614 444 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 SYNGR3O43761 229 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 JRKO75564 520 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 WISP2O76076 250 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 DDX58O95786 925 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 MLYCDO95822 493 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF23P17027 643 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 AHRP35869 848 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 NOVP48745 357 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 ATP12AP54707 1039 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 EIF5P55010 431 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 ZBED6P86452 979 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 TMEM35AQ53FP2 167 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 FAM171BQ6P995 826 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 CYP20A1Q6UW02 462 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 TSPAN33Q86UF1 283 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 NGEFQ8N5V2 710 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 WDSUB1Q8N9V3 476 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 OR1J2Q8NGS2 313 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 WDFY2Q96P53 400 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 PDZD7Q9H5P4 517 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 OR14J1Q9UGF5 321 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 POLG2Q9UHN1 485 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 CNTLNQ9NXG0 1405 aa3.15□□□□□ -1.91
ANKRD28-210ENST00000479043 UNC13BO14795 1591 aa3.15□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms