RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 CXorf40AQ8TE69 158 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 THAP11Q96EK4 314 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 SIPA1Q96FS4 1042 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 DCUN1D1Q96GG9 259 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 ZNF778Q96MU6 729 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 VPS35Q96QK1 796 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 OMDQ99983 421 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 CLPBQ9H078 707 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 PLAC1Q9HBJ0 212 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 SGK2Q9HBY8 427 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 PREBQ9HCU5 417 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 PCDH12Q9NPG4 1184 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 IL26Q9NPH9 171 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.96□□□□□ -1.3
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SHQ1-207ENST00000475558 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 B4GALT6Q9UBX8 382 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 SPO11Q9Y5K1 396 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 MYOFQ9NZM1 2061 aa6.96□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 CEP192Q8TEP8 1941 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 A0A096LPK6 155 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 LRRC72A6NJI9 287 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 H3BQF6 201 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 TYROBPO43914 113 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 MAGEC1O60732 1142 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 VPS26AO75436 327 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 RFPL1O75677 317 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 TM7SF2O76062 418 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 CBSLP0DN79 551 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 CD59P13987 128 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 PKMP14618 531 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 HOXB2P14652 356 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 CTPS1P17812 591 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 DGKAP23743 735 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 ARNTP27540 789 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 FOXN2P32314 431 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 HPDP32754 393 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 CBSP35520 551 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 MAGEA12P43365 314 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 RGS4P49798 205 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 ATP6V0D1P61421 351 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 XIAPP98170 497 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 CTBP1Q13363 440 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 NFATC2Q13469 925 aa6.95□□□□□ -1.3
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SHQ1-207ENST00000475558 ACOX1Q15067 660 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 ATG16L1Q676U5 607 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 LRRC66Q68CR7 880 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 TTC23LQ6PF05 361 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 MACC1Q6ZN28 852 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 SH2D5Q6ZV89 423 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 MINDY1Q8N5J2 469 aa6.95□□□□□ -1.3
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SHQ1-207ENST00000475558 OR13C4Q8NGS5 318 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 OR6K2Q8NGY2 324 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 MZB1Q8WU39 189 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 HMGB4Q8WW32 186 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 KCNJ9Q92806 393 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 INPP5DQ92835 1189 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 FAM131CQ96AQ9 280 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 AGAP2Q99490 1192 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 COPS8Q99627 209 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 MCMBPQ9BTE3 642 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 NMRAL1Q9HBL8 299 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 CAPN10Q9HC96 672 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 PRDM9Q9NQV7 894 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 ITM2CQ9NQX7 267 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-207ENST00000475558 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa6.95□□□□□ -1.3
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