RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468872.5

LSM5-209, Transcript of LSM5 homolog, U6 small nuclear RNA and mRNA degradation associated, human

TSL 2

Gene LSM5, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LSM5-209	ENST00000468872	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	CLIP4	Q8N3C7	705 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	PTER	Q96BW5	349 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	MMP27	Q9H306	513 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	KCNK15	Q9H427	330 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	KLHL20	Q9Y2M5	609 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872		A8MXE2	369 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	RFPL2	O75678	378 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	GLUD1	P00367	558 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	NMBR	P28336	390 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	KCNJ4	P48050	445 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	GLUD2	P49448	558 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	SIRPA	P78324	504 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	ALCAM	Q13740	583 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	PLCB4	Q15147	1175 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	MEP1A	Q16819	746 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	TEX38	Q6PEX7	206 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	KRT77	Q7Z794	578 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	CEP57	Q86XR8	500 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	EMC1	Q8N766	993 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	SEMA3C	Q99985	751 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	KDM6B	O15054	1643 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872		A0A1W2PP11	408 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	TRBC2	A0A5B9	178 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872		J3QR06	171 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	CLGN	O14967	610 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	MID1	O15344	667 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	KDM4B	O94953	1096 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	CLDN14	O95500	239 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	MYBL1	P10243	752 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	ZNF12	P17014	697 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	KCNA5	P22460	613 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	CPT2	P23786	658 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	CCR3	P51677	355 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	RAD23A	P54725	363 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	LTB	Q06643	244 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	KRT33B	Q14525	404 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	NFATC4	Q14934	902 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	CRY2	Q49AN0	593 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	GPR180	Q86V85	440 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	PM20D2	Q8IYS1	436 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	ZNF114	Q8NC26	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	RBM15B	Q8NDT2	890 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	SCMH1	Q96GD3	660 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	MED30	Q96HR3	178 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	AMACR	Q9UHK6	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LSM5-209	ENST00000468872	URAD	A6NGE7	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	NDUFS4	O43181	175 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	GGPS1	O95749	300 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	VPREB1	P12018	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	S1PR1	P21453	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	NR2F2	P24468	414 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	CDH13	P55290	713 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	EGR4	Q05215	589 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	ZNF155	Q12901	538 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	MYBPH	Q13203	477 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	TCP11X2	Q5H9J9	407 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LSM5-209	ENST00000468872	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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