RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467748.1

RABGGTB-206, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 468 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-206ENST00000467748 IRAK4Q9NWZ3 460 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 ATRNO75882 1429 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 SCAPERQ9BY12 1400 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 ARHGAP23Q9P227 1491 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 DEPDC5O75140 1603 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 MROH2AA6NES4 1674 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 A0A1W2PRG0 241 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 OR5K3A6NET4 321 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNN4O15554 427 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 JRKO75564 520 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 ICAM1P05362 532 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 ELF1P32519 619 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 CCR9P51686 369 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 WDR38Q5JTN6 314 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 LCN10Q6JVE6 187 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 ANO5Q75V66 913 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 NAXEQ8NCW5 288 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 OR10V1Q8NGI7 309 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 OR1J2Q8NGS2 313 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 HM13Q8TCT9 377 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 TMEM255BQ8WV15 326 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 RFFLQ8WZ73 363 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 ARHGEF26Q96DR7 871 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 EGLN2Q96KS0 407 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 DUX3Q96PT4 197 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 MAP7D2Q96T17 732 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 SLC26A6Q9BXS9 759 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 TRPC7Q9HCX4 862 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 STK39Q9UEW8 545 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 POLG2Q9UHN1 485 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 MSH6P52701 1360 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-206ENST00000467748 IQGAP1P46940 1657 aa3.84□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 SMCHD1A6NHR9 2005 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 SYNGR3O43761 229 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 CTSVO60911 334 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 PAX1P15863 534 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 KRT9P35527 623 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 AHRP35869 848 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 MMP14P50281 582 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 MED22Q15528 200 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF805Q5CZA5 627 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 ARHGAP17Q68EM7 881 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 CEACAM20Q6UY09 585 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 RASGEF1CQ8N431 466 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 ETNPPLQ8TBG4 499 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 PHF21AQ96BD5 680 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 PPM1MQ96MI6 270 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 F2RL3Q96RI0 385 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 KCNE2Q9Y6J6 123 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 ABCC1P33527 1531 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 IQGAP2Q13576 1575 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 REREQ9P2R6 1566 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 SHANK3Q9BYB0 1731 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 UTRNP46939 3433 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 KIF14Q15058 1648 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 PRAG1Q86YV5 1406 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 SERINC4A6NH21 518 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 PLPP2O43688 288 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 BAG4O95429 457 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 PATE4P0C8F1 98 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 GM2AP17900 193 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 MBTD1Q05BQ5 628 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 MYLK3Q32MK0 819 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 PLXDC2Q6UX71 529 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 SEPT14Q6ZU15 432 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 Q75L30 129 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 FCAMRQ8WWV6 532 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 DNAAF4Q8WXU2 420 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 LITAFQ99732 161 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 PDZD7Q9H5P4 517 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 FAM118AQ9NWS6 357 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 MTMR10Q9NXD2 777 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGGTB-206ENST00000467748 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms