RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460944.6

DDR1-241, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

TSL 5

Gene DDR1, Length 1,248 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-241ENST00000460944 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 AVILO75366 819 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 POP7O75817 140 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 PRSS56P0CW18 603 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 F3P13726 295 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 PAMP19021 973 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 IDSP22304 550 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 C2orf54Q08AI8 447 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 DBN1Q16643 649 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 BCL7AQ4VC05 210 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 PERM1Q5SV97 790 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 HES3Q5TGS1 186 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 CERS6Q6ZMG9 384 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 MAATS1Q7Z4T9 603 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 C11orf96Q7Z7L8 435 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 SFTPA2Q8IWL1 248 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 PIANPQ8IYJ0 282 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 ARL14Q8N4G2 192 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 AVL9Q8NBF6 648 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 WDR48Q8TAF3 677 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 PATE1Q8WXA2 126 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 SGF29Q96ES7 293 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 CCDC3Q9BQI4 270 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 VPS37BQ9H9H4 285 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 TREX1Q9NSU2 369 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 LRIT1Q9P2V4 623 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 TBC1D29Q9UFV1 150 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 SLC23A2Q9UGH3 650 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 CDC23Q9UJX2 597 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa18.11■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 A0A0G2JNG1 304 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 MAGEB16A2A368 324 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 FAM187AA6NFU0 413 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 OR5K4A6NMS3 321 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 EFCAB8A8MWE9 144 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 KIR2DS3K7RE56 304 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 SMAPO00193 183 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 NDC80O14777 642 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 OPA1O60313 960 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 PNLIPP16233 465 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 NMBRP28336 390 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 NSG1P42857 185 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 SHC2P98077 582 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 B4GALNT1Q00973 533 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 KIR2DS5Q14953 304 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 SLC9B2Q86UD5 537 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 SFRP1Q8N474 314 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 OTUD6BQ8N6M0 293 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 SGSM3Q96HU1 749 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 TRIM31Q9BZY9 425 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 CATSPERZQ9NTU4 200 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 RNF215Q9Y6U7 377 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 BPTFQ12830 3046 aa18.1■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 MGAT4DA6NG13 374 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 F8W8V4 182 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 QSOX1O00391 747 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 AP2A2O94973 939 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 JUPP14923 745 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 SPINK2P20155 84 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 PRLHRP49683 370 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 DMPKQ09013 629 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 MORF4L2Q15014 288 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 IYDQ6PHW0 289 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 CES3Q6UWW8 571 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 MICALCLQ6ZW33 695 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 MPP5Q8N3R9 675 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 SLC37A2Q8TED4 501 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 MFSD3Q96ES6 412 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 SNF8Q96H20 258 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 PRDM8Q9NQV8 689 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 KLK13Q9UKR3 277 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 WASF3Q9UPY6 502 aa18.09■□□□□ 0.49
DDR1-241ENST00000460944 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa18.08■□□□□ 0.48
DDR1-241ENST00000460944 A6NCN8 305 aa18.08■□□□□ 0.48
DDR1-241ENST00000460944 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
DDR1-241ENST00000460944 EML2O95834 649 aa18.08■□□□□ 0.48
DDR1-241ENST00000460944 HALP42357 657 aa18.08■□□□□ 0.48
DDR1-241ENST00000460944 MAGEA3P43357 314 aa18.08■□□□□ 0.48
DDR1-241ENST00000460944 FASLGP48023 281 aa18.08■□□□□ 0.48
DDR1-241ENST00000460944 SPIDRQ14159 915 aa18.08■□□□□ 0.48
DDR1-241ENST00000460944 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa18.08■□□□□ 0.48
DDR1-241ENST00000460944 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
DDR1-241ENST00000460944 WASH2PQ6VEQ5 465 aa18.08■□□□□ 0.48
DDR1-241ENST00000460944 PACS1Q6VY07 963 aa18.08■□□□□ 0.48
DDR1-241ENST00000460944 CCNJLQ8IV13 435 aa18.08■□□□□ 0.48
DDR1-241ENST00000460944 TRIM48Q8IWZ4 208 aa18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms