RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460639.2

ATRX-204, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, humanhuman

TSL 3

Gene ATRX, Length 461 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRX-204ENST00000460639 TYK2P29597 1187 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 MAGEA8P43361 318 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 ASMTP46597 345 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 HTR6P50406 440 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 PRKCEQ02156 737 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 TEFQ10587 303 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 GRIK3Q13003 919 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 GPM6BQ13491 265 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 DPYSQ14117 519 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 KARSQ15046 597 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 GXYLT1Q4G148 440 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 TMEM119Q4V9L6 283 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 TMEM211Q6ICI0 200 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 PODNL1Q6PEZ8 512 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 KIRREL2Q6UWL6 708 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 MTSS1LQ765P7 747 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 SLC29A4Q7RTT9 530 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 PRSS45Q7RTY3 260 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 MIER3Q7Z3K6 550 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 SYVN1Q86TM6 617 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 SCYL3Q8IZE3 742 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 RASGEF1CQ8N431 466 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 EXT2Q93063 718 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 GIMAP5Q96F15 307 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 GSDMAQ96QA5 445 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 CTAGE1Q96RT6 745 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 MMS19Q96T76 1030 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 CIPCQ9C0C6 399 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 EGLN1Q9GZT9 426 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 GORASP2Q9H8Y8 452 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 NGBQ9NPG2 151 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 PTGFRNQ9P2B2 879 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 PCSK1NQ9UHG2 260 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 AMFRQ9UKV5 643 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 WDR37Q9Y2I8 494 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 PKP3Q9Y446 797 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 JRKLQ9Y4A0 524 aa4.55□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 ACEP12821 1306 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 LRRC3CA6NJW4 275 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 USP17L23D6RBM5 183 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 F8WDY8 70 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 H0YHG0 523 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 H0YIG0 161 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 TRIM77I1YAP6 450 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 O00370 1275 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 PTGESO14684 152 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 SUV39H1O43463 412 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 PRAMEF2O60811 474 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 TSC22D2O75157 780 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 MED24O75448 989 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 DAB1O75553 588 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 ASGR1P07306 291 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 GNAZP19086 355 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 GPD1P21695 349 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 DNASE1P24855 282 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 SOX6P35712 828 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 FRKP42685 505 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 GABRB2P47870 512 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 DGKQP52824 942 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 COPB1P53618 953 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 CETN1Q12798 172 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 RIPK1Q13546 671 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 SNAPC1Q16533 368 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 TAZQ16635 292 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 ETFRF1Q6IPR1 90 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 FBXO42Q6P3S6 717 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 CES3Q6UWW8 571 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 QSOX2Q6ZRP7 698 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 PTCHD4Q6ZW05 846 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 GPAT4Q86UL3 456 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 CDH26Q8IXH8 852 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 OR52L2PQ8NGH6 319 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 BCAS4Q8TDM0 211 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 COG3Q96JB2 828 aa4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
ATRX-204ENST00000460639 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
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