RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460573.5

C9orf3-209, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-209ENST00000460573 KLHL33A6NCF5 533 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 TMEM8BA6NDV4 472 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 QSOX1O00391 747 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 ARNTP27540 789 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 NSG1P42857 185 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 TTPAP49638 278 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 CTBSQ01459 385 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 DBN1Q16643 649 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 LONRF1Q17RB8 773 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 PACS1Q6VY07 963 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 TAF8Q7Z7C8 310 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 PNPLA1Q8N8W4 532 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 GPR150Q8NGU9 434 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 PWWP2AQ96N64 755 aa22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
C9orf3-209ENST00000460573 TIMM29Q9BSF4 260 aa22.15■■□□□ 1.14
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C9orf3-209ENST00000460573 ESYT3A0FGR9 886 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 F8W8V4 182 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 YY2O15391 372 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 BANF1O75531 89 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 AP2A2O94973 939 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 PRSS56P0CW18 603 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 GIMD1P0DJR0 217 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 VCLP18206 1134 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 CLCNKAP51800 687 aa22.14■■□□□ 1.13
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C9orf3-209ENST00000460573 B4GALNT1Q00973 533 aa22.14■■□□□ 1.13
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C9orf3-209ENST00000460573 BCL7AQ4VC05 210 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 CCDC157Q569K6 752 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 TMEM220Q6QAJ8 160 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 CEP128Q6ZU80 1094 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 EID2Q8N6I1 236 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 CALML6Q8TD86 181 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 TCF12Q99081 682 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 TSPYL1Q9H0U9 437 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 CHMP2BQ9UQN3 213 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 MSRB2Q9Y3D2 182 aa22.14■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 FFAR2O15552 330 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
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C9orf3-209ENST00000460573 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
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C9orf3-209ENST00000460573 TRADDQ15628 312 aa22.13■■□□□ 1.13
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C9orf3-209ENST00000460573 NRROSQ86YC3 692 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 ZNF547Q8IVP9 402 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 IGDCC3Q8IVU1 814 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 ZBED8Q8IZ13 594 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 FAM181AQ8N9Y4 354 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 GLMNQ92990 594 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 CAAP1Q9H8G2 361 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 BTBD3Q9Y2F9 522 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 PRKAB1Q9Y478 270 aa22.13■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 EPG5Q9HCE0 2579 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 OR2AG2A6NM03 316 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 CBFA2T3O75081 653 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 GSTM1P09488 218 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 ACTR1BP42025 376 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 CTSCP53634 463 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 ACTR1AP61163 376 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 GSTM4Q03013 218 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 INSCQ1MX18 579 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 DEFB133Q30KQ1 61 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 STEAP4Q687X5 459 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 CRTC3Q6UUV7 619 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 FBXO36Q8NEA4 188 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 CCL4L1Q8NHW4 92 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 PYROXD1Q8WU10 500 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 SGF29Q96ES7 293 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 BOCQ9BWV1 1114 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 VPS37BQ9H9H4 285 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 EVA1BQ9NVM1 165 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 FTSJ1Q9UET6 329 aa22.12■■□□□ 1.13
C9orf3-209ENST00000460573 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa22.12■■□□□ 1.13
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