RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CHKAP35790 457 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 TAF6P49848 677 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 TUBP50607 506 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 MECP2P51608 486 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 TDGF1P3P51864 188 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 DCAF7P61962 342 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 TRDNQ13061 729 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP2R5CQ13362 524 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 MYBPC3Q14896 1274 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 ZNF174Q15697 407 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 C3AR1Q16581 482 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 SPATA1Q5VX52 437 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 NKAIN2Q5VXU1 208 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 SEL1L3Q68CR1 1132 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 FCRL6Q6DN72 434 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 NCAPH2Q6IBW4 605 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 LVRNQ6Q4G3 990 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CASC1Q6TDU7 716 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 IGFL3Q6UXB1 125 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 Q6YL49 198 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 NEK8Q86SG6 692 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 HORMAD1Q86X24 394 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 GKN2Q86XP6 184 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 SFTPA2Q8IWL1 248 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 PDCL2Q8N4E4 241 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 MCPH1Q8NEM0 835 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 GPR156Q8NFN8 814 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 OR4D9Q8NGE8 314 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 ETNPPLQ8TBG4 499 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 PMM1Q92871 262 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CNDP1Q96KN2 507 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CEP295NLQ96MC4 621 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CGRRF1Q99675 332 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 SERHL2Q9H4I8 314 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 RASSF1Q9NS23 344 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 GGA2Q9UJY4 613 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 COX11Q9Y6N1 276 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 HERC2O95714 4834 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 TTC26A0AVF1 554 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 NKX2-6A6NCS4 301 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 TTC34A8MYJ7 566 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CLDN4O14493 209 aa4.66□□□□□ -1.66
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RABGGTB-203ENST00000459697 RAD51BO15315 384 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CTIFO43310 598 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 EDIL3O43854 480 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CDC45O75419 566 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 KIAA0754O94854 1291 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 PCDH8O95206 1070 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 TDP2O95551 362 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CD1CP29017 333 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CA5AP35218 305 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 GARSP41250 739 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 TSFMP43897 325 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CLK3P49761 638 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 RARRES1P49788 294 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 PTTG1IPP53801 180 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 TAS2R38P59533 333 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 PPARDQ03181 441 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 RBPJQ06330 500 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 ADCY2Q08462 1091 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM132DQ14C87 1099 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 PPP2R5AQ15172 486 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 EPHA7Q15375 998 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 Q4G0T1 1027 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 TMTC3Q6ZXV5 915 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 SYVN1Q86TM6 617 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 GLCCI1Q86VQ1 547 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 C3orf56Q8N813 242 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 CHST14Q8NCH0 376 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 OR5M3Q8NGP4 307 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 OVCA2Q8WZ82 227 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 TBATAQ96M53 351 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 AGAP3Q96P47 875 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 NDC1Q9BTX1 674 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 BHMT2Q9H2M3 363 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 POLD4Q9HCU8 107 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 KMT5AQ9NQR1 393 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 FBXO8Q9NRD0 319 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGGTB-203ENST00000459697 YAE1D1Q9NRH1 226 aa4.66□□□□□ -1.66
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