RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF398Q8TD17 642 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC46A1Q96NT5 459 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 RDH14Q9HBH5 336 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 PRDM8Q9NQV8 689 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 THSD1Q9NS62 852 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNK4Q9NYG8 393 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa13.93□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 PMS2P1A4D2B8 440 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 J3QKU1 62 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 LDB2O43679 373 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 FGGP02679 453 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 VCLP18206 1134 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 CD1CP29017 333 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 FDFT1P37268 417 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 GPLD1P80108 840 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 XIAPP98170 497 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 SQSTM1Q13501 440 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 CCNG2Q16589 344 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 USP53Q70EK8 1073 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 RAB11FIP2Q7L804 512 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 LINC00523Q86TU6 105 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 CCDC89Q8N998 374 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 OR13C4Q8NGS5 318 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 MAIP1Q8WWC4 291 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM159Q96B96 161 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 SH3KBP1Q96B97 665 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC38A3Q99624 504 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 DPYSL5Q9BPU6 564 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 NUDT22Q9BRQ3 303 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 SEMA6CQ9H3T2 930 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 ASB8Q9H765 288 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 ETNK1Q9HBU6 452 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 CPNE7Q9UBL6 633 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 COL6A6A6NMZ7 2263 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 AGAP14A8MT82 685 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 PDZK1P1A8MUH7 402 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 PLD2O14939 933 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 CEP104O60308 925 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNJ13O60928 360 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 SUN1O94901 812 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 TNFSF15O95150 251 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 ITGA2BP08514 1039 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 TPH1P17752 444 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 MSH3P20585 1137 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 ITGALP20701 1170 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 AKT1P31749 480 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 CSF2RBP32927 897 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 CTSCP53634 463 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 TMPRSS15P98073 1019 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 POU6F1Q14863 301 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 LONRF2Q1L5Z9 754 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 PHF19Q5T6S3 580 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 AGAP9Q5VTM2 703 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 NKAIN2Q5VXU1 208 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 FOXR1Q6PIV2 292 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 WASH2PQ6VEQ5 465 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 FBXO39Q8N4B4 442 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 OR10G6Q8NH81 332 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 ULK4Q96C45 1275 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 SEMA4CQ9C0C4 833 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 WASH6PQ9NQA3 447 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 PAK5Q9P286 719 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 LOXL2Q9Y4K0 774 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 OR2AG2A6NM03 316 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 CDRT15L2A8MXV6 281 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 E7EVH7 732 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 H7C0S8 307 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 CCL22O00626 93 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 DUX1O43812 170 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 ETS1P14921 441 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 BRAFP15056 766 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 IDSP22304 550 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 RPL10P27635 214 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 CXCR5P32302 372 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 LMAN1P49257 510 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 EPHA4P54764 986 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 DMPKQ09013 629 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 CDH17Q12864 832 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 SEMA5AQ13591 1074 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 SEPT6Q14141 434 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM220Q6QAJ8 160 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54 ms