RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 SEL1L2Q5TEA6 688 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 NKAIN2Q5VXU1 208 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 TEX19Q8NA77 164 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 SPATA22Q8NHS9 363 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ACTL9Q8TC94 416 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 COG1Q8WTW3 980 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PMEPA1Q969W9 287 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 SCRN2Q96FV2 425 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ABHD17AQ96GS6 310 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CAPZA3Q96KX2 299 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 FERMT1Q9BQL6 677 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ADGRE3Q9BY15 652 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 GLOD4Q9HC38 313 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 RSPH14Q9UHP6 348 aa11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 UNC79Q9P2D8 2635 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PRR19A6NJB7 356 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 OR5K4A6NMS3 321 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 HACD1B0YJ81 288 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 NKX2-8O15522 239 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 MTSS1O43312 755 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CEP104O60308 925 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 FZD6O60353 706 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 STK17BO94768 372 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 TJP3O95049 919 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PIRTP0C851 137 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ZNF30P17039 623 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 GM2AP17900 193 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 MPSTP25325 297 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 RBL1P28749 1068 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CD97P48960 835 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 HHEXQ03014 270 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 NOMO1Q15155 1222 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 DEFB109BQ30KR1 87 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CCDC70Q6NSX1 233 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 DOK6Q6PKX4 331 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZVL8 140 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PID1Q7Z2X4 250 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 SLC9B2Q86UD5 537 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 NLRP8Q86W28 1048 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PLXDC1Q8IUK5 500 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 SFRP1Q8N474 314 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 BMPERQ8N8U9 685 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 SEC14L1Q92503 715 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 AP2M1Q96CW1 435 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 PBKQ96KB5 322 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 TEKT5Q96M29 485 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A51Q9H1U9 297 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 CARD9Q9H257 536 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 OCIAD1Q9NX40 245 aa11.53□□□□□ -0.56
PRAME-210ENST00000442481 KCNN4O15554 427 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 VPS4BO75351 444 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 STK10O94804 968 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 CLDN7O95471 211 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 PRLP01236 227 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 RBP3P10745 1247 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 STAT5AP42229 794 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 RPL26P61254 145 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 CDK18Q07002 472 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 WASHC5Q12768 1159 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 QPCTQ16769 361 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 SNAP47Q5SQN1 464 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 TCTN3Q6NUS6 607 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 C16orf46Q6P387 395 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 RFLNAQ6ZTI6 216 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 ZNF765Q7L2R6 523 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 ZNF567Q8N184 647 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 PELI3Q8N2H9 469 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A41Q8N5S1 370 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 IPMKQ8NFU5 416 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 CCHCR1Q8TD31 782 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 SLC37A2Q8TED4 501 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 PATE1Q8WXA2 126 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 NCSTNQ92542 709 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 MIB2Q96AX9 1013 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 MS4A14Q96JA4 679 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 RMI1Q9H9A7 625 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 PRDM8Q9NQV8 689 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 VPS18Q9P253 973 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 CDC23Q9UJX2 597 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 KCND3Q9UK17 655 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 VPS4AQ9UN37 437 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 SHOC2Q9UQ13 582 aa11.52□□□□□ -0.57
PRAME-210ENST00000442481 POLHQ9Y253 713 aa11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms