RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC190Q86UF4 302 aa4.63□□□□□ -1.67
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CBX1P4-201ENST00000439415 MMRN2Q9H8L6 949 aa4.62□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 LMAN1LQ9HAT1 526 aa4.62□□□□□ -1.67
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CBX1P4-201ENST00000439415 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
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CBX1P4-201ENST00000439415 SPASTQ9UBP0 616 aa4.62□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
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CBX1P4-201ENST00000439415 CCPG1Q9ULG6 757 aa4.62□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa4.62□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PIPSLA2A3N6 862 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 DPPA5A6NC42 116 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PATE3B3GLJ2 98 aa4.61□□□□□ -1.67
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CBX1P4-201ENST00000439415 PTGESO14684 152 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 MCF2LO15068 1137 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TTI1O43156 1089 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 NDUFS4O43181 175 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TSPAN1O60635 241 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 RGS11O94810 467 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PGLSO95336 258 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB40ALP0C0E4 278 aa4.61□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 UNGP13051 313 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
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