RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EPOPA6NHQ4 379 aa17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TTC36A6NLP5 189 aa17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 H0Y626 953 aa17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATP6V1B2P21281 511 aa17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC7A2P52569 658 aa17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GEMP55040 296 aa17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OXCT1P55809 520 aa17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NAA20P61599 178 aa17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MPP1Q00013 466 aa17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TNK2Q07912 1038 aa17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF460Q14592 562 aa17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TBC1D15Q8TC07 691 aa17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HEXDCQ8WVB3 486 aa17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC45A3Q96JT2 553 aa17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRIM15Q9C019 465 aa17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MUC3BQ9H195 1237 aa17.07■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 H3BMQ9 156 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KDELR3O43731 214 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PMPCBO75439 489 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GNAO1P09471 354 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RPL10P27635 214 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GRIA3P42263 894 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF235Q14590 738 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DUSP6Q16828 381 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ANKDD1AQ495B1 522 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CUZD1Q86UP6 607 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EPHX4Q8IUS5 362 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PGBD5Q8N414 524 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CPXM2Q8N436 756 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 THAP11Q96EK4 314 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 COG8Q96MW5 612 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF599Q96NL3 588 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TBL1YQ9BQ87 522 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C9orf16Q9BUW7 83 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LMAN2LQ9H0V9 348 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC28A3Q9HAS3 691 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGSF5Q9NSI5 407 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ACTL7AQ9Y615 435 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DYTNA2CJ06 578 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SAC3D1A6NKF1 404 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BBIP1A8MTZ0 92 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SUPT3HO75486 399 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 POU2F2P09086 479 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TAS2R39P59534 338 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DSC2Q02487 901 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATP6AP1Q15904 470 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PPP1R3AQ16821 1122 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPRED1Q7Z699 444 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DENND6AQ8IWF6 608 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ING5Q8WYH8 240 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FICDQ9BVA6 458 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PALMDQ9NP74 551 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TDP1Q9NUW8 608 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ABCD2Q9UBJ2 740 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 REV3LO60673 3130 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MYOFQ9NZM1 2061 aa17.06■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CBX4O00257 560 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GIPC1O14908 333 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRAMEF12O95522 483 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CD86P42081 329 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATP6V0D1P61421 351 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 POU4F1Q01851 419 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CDH18Q13634 790 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 INPP5AQ14642 412 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAP7D1Q3KQU3 841 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TECRLQ5HYJ1 363 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TBCELQ5QJ74 424 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PRMT9Q6P2P2 845 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TPGS1Q6ZTW0 290 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPATA6LQ8N4H0 392 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WFDC5Q8TCV5 224 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FEM1CQ96JP0 617 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MRGPRX2Q96LB1 330 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FSD1LQ9BXM9 530 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMEM9Q9P0T7 183 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WDR37Q9Y2I8 494 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C2orf16Q68DN1 1984 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DHRS12A0PJE2 317 aa17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP17.05■□□□□ 0.32
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MUSKO15146 869 aa17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms