RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 CALCRLQ16602 461 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CATSPER3Q86XQ3 398 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM86AQ8N2M4 240 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SMARCE1Q969G3 411 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 IQCDQ96DY2 449 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SLC2A13Q96QE2 648 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PANX2Q96RD6 677 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TTLL2Q9BWV7 592 aa6.32□□□□□ -1.4
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PTPRK-211ENST00000429595 CUEDC2Q9H467 287 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 MANSC1Q9H8J5 431 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 MAGEF1Q9HAY2 307 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 DPP3Q9NY33 737 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ENTPD4Q9Y227 616 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 DERAQ9Y315 318 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 LRBAP50851 2863 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 NBASA2RRP1 2371 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 MED13Q9UHV7 2174 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 HEATR9A2RTY3 570 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CCDC151A5D8V7 595 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 MKRN2OSH3BPM6 223 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SLC16A4O15374 487 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 FAM155BO75949 473 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PRKD3O94806 890 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 HAUS5O94927 633 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CELA2AP08217 269 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SBK3P0C264 359 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 LONP1P36776 959 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PBX1P40424 430 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PRPHP41219 470 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 COPB1P53618 953 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF425Q6IV72 752 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TAOK1Q7L7X3 1001 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 IQUBQ8NA54 791 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SORCS1Q8WY21 1168 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 FBXO32Q969P5 355 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 RAB24Q969Q5 203 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CCSER1Q9C0I3 900 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CAAP1Q9H8G2 361 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 EBF2Q9HAK2 575 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 RMND1Q9NWS8 449 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 MAN1B1Q9UKM7 699 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CDYLQ9Y232 598 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 NF1P21359 2839 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00473A8K010 186 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 F8VP50 259 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SCAMP1O15126 338 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 OGTO15294 1046 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 DTNBO60941 627 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 PIAS2O75928 621 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 SERPINC1P01008 464 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 LDLRP01130 860 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 HGFP14210 728 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CHKAP35790 457 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 NUDT1P36639 197 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 LIG4P49917 911 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CTXN1P60606 82 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ST8SIA6P61647 398 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 CUL4BQ13620 913 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 TRIM14Q14142 442 aa6.3□□□□□ -1.4
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PTPRK-211ENST00000429595 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
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PTPRK-211ENST00000429595 ASB18Q6ZVZ8 466 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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PTPRK-211ENST00000429595 ADGRF2Q8IZF7 708 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 NUP93Q8N1F7 819 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF366Q8N895 744 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 C4orf32Q8N8J7 132 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 NAT6Q93015 286 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRK-211ENST00000429595 MYLPFQ96A32 169 aa6.3□□□□□ -1.4
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