RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VSNL1P62760 191 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GSTM4Q03013 218 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MGAT5Q09328 741 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF542PQ5EBM4 170 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LVRNQ6Q4G3 990 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DBX2Q6ZNG2 339 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C11orf96Q7Z7L8 435 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRRTM4Q86VH4 590 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC26A11Q86WA9 606 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GALNT13Q8IUC8 556 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HID1Q8IV36 788 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR2I1PQ8NGU4 316 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C9orf72Q96LT7 481 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TIMM29Q9BSF4 260 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EDEM2Q9BV94 578 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NINJ2Q9NZG7 142 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SPASTQ9UBP0 616 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FBXO5Q9UKT4 447 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAB21Q9UL25 225 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FANCMQ8IYD8 2048 aa8.05□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NEMP2A6NFY4 417 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM159BA6NKW6 160 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR2AG2A6NM03 316 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LMO7DNF2Z398 122 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 F8W8V4 182 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 H3BMM5 538 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TPP1O14773 563 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCAMP1O15126 338 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AQP9O43315 295 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KCNJ13O60928 360 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NDUFS3O75489 264 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FTH1P02794 183 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ESR1P03372 595 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM153BP0C7A2 387 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GIMD1P0DJR0 217 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NEFHP12036 1026 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CTSCP53634 463 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CTBSQ01459 385 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DMPKQ09013 629 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NUMA1Q14980 2115 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ELOCQ15369 112 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 KYNUQ16719 465 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM153CQ494X1 144 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM220Q6QAJ8 160 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CRTC3Q6UUV7 619 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NRROSQ86YC3 692 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 EGFL6Q8IUX8 553 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DENND6AQ8IWF6 608 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC25A45Q8N413 288 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CLDN19Q8N6F1 224 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OTUD6BQ8N6M0 293 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR2L2Q8NH16 312 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDKL2Q92772 493 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SGF29Q96ES7 293 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 BIRC8Q96P09 236 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MCMBPQ9BTE3 642 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PARD6BQ9BYG5 372 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GSDMCQ9BYG8 508 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CLPBQ9H078 707 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM168Q9H0V1 697 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CAAP1Q9H8G2 361 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VPS37BQ9H9H4 285 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TM7SF3Q9NS93 570 aa8.04□□□□□ -1.12
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UCKL1Q9NWZ5 548 aa8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.4 ms