RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409248.8

C4orf48-201, Transcript of chromosome 4 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene C4orf48, Length 433 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48-201ENST00000409248 MC4RP32245 332 aa20.51■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ACTR1BP42025 376 aa20.51■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ARSDP51689 593 aa20.51■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ACTR1AP61163 376 aa20.51■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.51■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 LDLRAP1Q5SW96 308 aa20.51■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 AFTPHQ6ULP2 937 aa20.51■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 CES3Q6UWW8 571 aa20.51■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ZBED8Q8IZ13 594 aa20.51■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 MFSD3Q96ES6 412 aa20.51■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.51■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 MSRB2Q9Y3D2 182 aa20.51■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 TEX264Q9Y6I9 313 aa20.51■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 FAM221BA6H8Z2 402 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 GRID2O43424 1007 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 SRP72O76094 671 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 AK4P27144 223 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ECHS1P30084 290 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 XIAPP98170 497 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 C14orf28Q4W4Y0 310 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 HES3Q5TGS1 186 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 OGFOD3Q6PK18 319 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 TMEM135Q86UB9 458 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 NRROSQ86YC3 692 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ANKMY2Q8IV38 441 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 FBXO36Q8NEA4 188 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 DDHD1Q8NEL9 900 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 GPR156Q8NFN8 814 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 OR6P1Q8NGX9 317 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 MAPK15Q8TD08 544 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 HDAC10Q969S8 669 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 CFAP36Q96G28 342 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 TTC25Q96NG3 672 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ABCG4Q9H172 646 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 NFU1Q9UMS0 254 aa20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 V9GYY5 206 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC162PA2VCL2 907 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 OPA1O60313 960 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 NOBOXO60393 691 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ACP5P13686 325 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 TNFRSF8P28908 595 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 SPANXN3Q5MJ09 141 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 SNX20Q7Z614 316 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 LRRTM4Q86VH4 590 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 IGDCC3Q8IVU1 814 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 WDR48Q8TAF3 677 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF398Q8TD17 642 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 PYROXD1Q8WU10 500 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ULK4Q96C45 1275 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ASB8Q9H765 288 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 CRLS1Q9UJA2 301 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 PRKAB1Q9Y478 270 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 CHUKO15111 745 aa20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 KMOO15229 486 aa20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 MTX2O75431 263 aa20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 CDK14O94921 469 aa20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 AKT1P31749 480 aa20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 CACNG1Q06432 222 aa20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 NFATC2Q13469 925 aa20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 BIRC2Q13490 618 aa20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 CRYMQ14894 314 aa20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 GPR33Q49SQ1 333 aa20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 GPRC6AQ5T6X5 926 aa20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 CCDC74AQ96AQ1 378 aa20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 GPR39O43194 453 aa20.47■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 UGT1A9O60656 530 aa20.47■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 VAPBO95292 243 aa20.47■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 SLC2A4P14672 509 aa20.47■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 JUPP14923 745 aa20.47■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 GLB1P16278 677 aa20.47■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 UGT1A6P19224 532 aa20.47■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 UGT1A1P22309 533 aa20.47■□□□□ 0.87
C4orf48-201ENST00000409248 UGT1A4P22310 534 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms