RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401029.3

CAPNS1P1-201, Transcript of calpain small subunit 1 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CAPNS1P1, Length 633 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P1-201ENST00000401029 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TUBGCP3Q96CW5 907 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 LRRC58Q96CX6 371 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MARK4Q96L34 752 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GCNAQ96QF7 691 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 LYSMD1Q96S90 227 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 HGH1Q9BTY7 390 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SPATA16Q9BXB7 569 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TRIM54Q9BYV2 358 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TRIM15Q9C019 465 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 RIC8BQ9NVN3 520 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 UBAP1Q9NZ09 502 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GALPQ9UBC7 116 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZNF225Q9UK10 706 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 APPL1Q9UKG1 709 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PACSIN3Q9UKS6 424 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 IKZF3Q9UKT9 509 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PPIL1Q9Y3C6 166 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.3□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 FAM234BA2RU67 622 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SUPT3HB4E1H0 165 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 FXYD1O00168 92 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 E2F3O00716 465 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ANGPT2O15123 496 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SOCS5O75159 536 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SUPT3HO75486 399 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 EEDO75530 441 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SLC22A3O75751 556 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ATP6AP2O75787 350 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 BAIAP3O94812 1187 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PGLSO95336 258 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TNFAIP8O95379 198 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 C1RP00736 705 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TFAP2AP05549 437 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GPIP06744 558 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PIRTP0C851 137 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CHRM3P20309 590 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CAPN3P20807 821 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 IL10P22301 178 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 VARSP26640 1264 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ERFP50548 548 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SLC7A2P52569 658 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 EPHB3P54753 998 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ERVK-8P63133 956 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PRKCQQ04759 706 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 IKBKEQ14164 716 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 RCAN2Q14206 197 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 INPP5AQ14642 412 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 VEPH1Q14D04 833 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 C6orf136Q5SQH8 315 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ARMC12Q5T9G4 340 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 KIAA1841Q6NSI8 718 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 FBXL19Q6PCT2 694 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SLC30A9Q6PML9 568 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 Q6ZSR9 355 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SNX20Q7Z614 316 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ARPINQ7Z6K5 226 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TMEM150AQ86TG1 271 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SYVN1Q86TM6 617 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ITIH5Q86UX2 942 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 SLC39A11Q8N1S5 342 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 RNF148Q8N7C7 305 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 DCAF4L2Q8NA75 395 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 TRPV3Q8NET8 790 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 FIBINQ8TAL6 211 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ATP6V1E2Q96A05 226 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CAPNS2Q96L46 248 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 YIPF3Q9GZM5 350 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PCDHAC1Q9H158 963 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 MUC3BQ9H195 1237 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 COQ10BQ9H8M1 238 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 RDH14Q9HBH5 336 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 HEBP1Q9NRV9 189 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 CMTM6Q9NX76 183 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 POLG2Q9UHN1 485 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 FAM50BQ9Y247 325 aa8.29□□□□□ -1.08
CAPNS1P1-201ENST00000401029 AP3M1Q9Y2T2 418 aa8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms