RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401008.6

PDZK1P1-201, Transcript of PDZ domain containing 1 pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PDZK1P1, Length 3,498 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1-201ENST00000401008 STAG3L4Q8TBR4 150 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 ZFP14Q9HCL3 533 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 PRM3Q9NNZ6 103 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 DNAJC28Q9NX36 388 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 KIAA1671Q9BY89 1806 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 CAPN8A6NHC0 703 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 SDHDO14521 159 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 GPC4O75487 556 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 CRCPO75575 148 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 PYGLP06737 847 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 COX4I1P13073 169 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 ITGALP20701 1170 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 XPAP23025 273 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 NNMTP40261 264 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 PTGER3P43115 390 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 HSPA7P48741 367 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 NUDT2P50583 147 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 CLCN7P51798 805 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 COPAP53621 1224 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 HERVK_113P63132 956 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 PLIN5Q00G26 463 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 ARHGEF7Q14155 803 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 GRB7Q14451 532 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 TCEA2Q15560 299 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 SLC14A2Q15849 920 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 PHKG1Q16816 387 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 ACAD11Q709F0 780 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 USP45Q70EL2 814 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 FRA10AC1Q70Z53 315 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 GPR149Q86SP6 731 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 CDYL2Q8N8U2 506 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 PYCR2Q96C36 320 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 EGFL8Q99944 293 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 ERVK-6Q9BXR3 956 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 SYTL2Q9HCH5 934 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 MAFFQ9ULX9 164 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 A0A1W2PQ67 120 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 TMEM202A6NGA9 273 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 FFAR3O14843 346 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 PIP5K1BO14986 540 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 GPR42O15529 346 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 SNX2O60749 519 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 C1SP09871 688 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 PIK3R1P27986 724 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 POLD2P49005 469 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 B4GALNT1Q00973 533 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 CLCQ05315 142 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 KRT72Q14CN4 511 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 TGFBIQ15582 683 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 CCDC6Q16204 474 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 SYCE2Q6PIF2 218 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 CYHR1Q6ZMK1 362 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 TPRG1Q6ZUI0 275 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 VRK3Q8IV63 474 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 FRS2Q8WU20 508 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 INPP5DQ92835 1189 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 ATP6V1E2Q96A05 226 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 KIAA1191Q96A73 305 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 RCN3Q96D15 328 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 CHFRQ96EP1 664 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 CNDP1Q96KN2 507 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 MRGPRX3Q96LB0 322 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 SLC39A3Q9BRY0 314 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 HGH1Q9BTY7 390 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 HACD3Q9P035 362 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 PRKAB1Q9Y478 270 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 WASF2Q9Y6W5 498 aa7.39□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 IL9P15248 144 aa7.38□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 SPAM1P38567 509 aa7.38□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 PAOXQ6QHF9 649 aa7.38□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 SNX20Q7Z614 316 aa7.38□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 HEPHQ9BQS7 1158 aa7.38□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 C1orf50Q9BV19 199 aa7.38□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 TUBB1Q9H4B7 451 aa7.38□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 RETREG1Q9H6L5 497 aa7.38□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 ELOVL2Q9NXB9 296 aa7.38□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 TBC1D14Q9P2M4 693 aa7.38□□□□□ -1.23
PDZK1P1-201ENST00000401008 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms