RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400919.7

FAAP20-204, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene FAAP20, Length 1,413 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-204ENST00000400919 ABCG4Q9H172 646 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-204ENST00000400919 VPS37BQ9H9H4 285 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-204ENST00000400919 CATSPERZQ9NTU4 200 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-204ENST00000400919 SLC23A2Q9UGH3 650 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-204ENST00000400919 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa27.02■■□□□ 1.92
FAAP20-204ENST00000400919 F8W8V4 182 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 RAD51CO43502 376 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 SNX2O60749 519 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 PRSS56P0CW18 603 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 GLB1P16278 677 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 ITGA8P53708 1063 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 B4GALNT1Q00973 533 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 DBN1Q16643 649 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 BCL7AQ4VC05 210 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 CES3Q6UWW8 571 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 C11orf96Q7Z7L8 435 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 RAB17Q9H0T7 212 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 TBC1D29Q9UFV1 150 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 MRFAP1Q9Y605 127 aa27.01■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 OR5K4A6NMS3 321 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 QSOX1O00391 747 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 VAPBO95292 243 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 IDSP22304 550 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 CALCOCO2Q13137 446 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP27■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 NAGSQ8N159 534 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 SNX24Q9Y343 169 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 CACNA1AO00555 2505 aa27■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 AP2A2O94973 939 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 F3P13726 295 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 PMLP29590 882 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 TTPAP49638 278 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 FOXK2Q01167 660 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 FOXC1Q12948 553 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 DHRS13Q6UX07 377 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 TMEM135Q86UB9 458 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 MAPK15Q8TD08 544 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 SIGLEC10Q96LC7 697 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 NAT9Q9BTE0 207 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 LRIT1Q9P2V4 623 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 PFDN6O15212 129 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 ZW10O43264 779 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 POLBP06746 335 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 PNLIPP16233 465 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 RPL21P46778 160 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 PRLHRP49683 370 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 ARL4CP56559 192 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 DMPKQ09013 629 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 MRNIPQ6NTE8 343 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 PACS1Q6VY07 963 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 ARL14Q8N4G2 192 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 OTUD6BQ8N6M0 293 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 AVL9Q8NBF6 648 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 WHRNQ9P202 907 aa26.99■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 A0A0G2JNG1 304 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 MGAT4DA6NG13 374 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 RHPN2P1A8MT19 583 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 PDZK1P1A8MUH7 402 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 KIR2DS3K7RE56 304 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 USP1O94782 785 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 GSTM1P09488 218 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 GSTM4Q03013 218 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 KIR2DS5Q14953 304 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 HIF1AQ16665 826 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 IYDQ6PHW0 289 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 GALNT15Q8N3T1 639 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 SFRP1Q8N474 314 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 OR2L2Q8NH16 312 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 WDR48Q8TAF3 677 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 PRDM8Q9NQV8 689 aa26.98■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 TTC4O95801 387 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 PGAM1P18669 254 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 MAZP56270 477 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 C8orf74Q6P047 294 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 WASH2PQ6VEQ5 465 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 CCNJLQ8IV13 435 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 SFTPA2Q8IWL1 248 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 CLDN19Q8N6F1 224 aa26.97■■□□□ 1.91
FAAP20-204ENST00000400919 PATE1Q8WXA2 126 aa26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms