RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375391.5

TMCO3-201, Transcript of transmembrane and coiled-coil domains 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TMCO3, Length 2,132 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3-201ENST00000375391 TRIM23P36406 574 aa20.02■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 CLCN7P51798 805 aa20.02■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 POU4F1Q01851 419 aa20.02■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 SLC18A2Q05940 514 aa20.02■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 AGERQ15109 404 aa20.02■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 NEK5Q6P3R8 708 aa20.02■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.02■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 TAOK1Q7L7X3 1001 aa20.02■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 CD200R1Q8TD46 325 aa20.02■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 NXNL1Q96CM4 212 aa20.02■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 COX14Q96I36 57 aa20.02■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 KDM4CQ9H3R0 1056 aa20.02■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 WDR26Q9H7D7 661 aa20.02■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 RAD18Q9NS91 495 aa20.02■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.01■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 H3BMM5 538 aa20.01■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 ESR1P03372 595 aa20.01■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 CCR7P32248 378 aa20.01■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 SLC12A2P55011 1212 aa20.01■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 CSHL1Q14406 222 aa20.01■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 KIAA0895LQ68EN5 471 aa20.01■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 FAM45BPQ6NSW5 357 aa20.01■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.01■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 CPNE9Q8IYJ1 553 aa20.01■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 FAM45AQ8TCE6 357 aa20.01■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 ULK4Q96C45 1275 aa20.01■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 DCUN1D1Q96GG9 259 aa20.01■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.01■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 TMEM216Q9P0N5 145 aa20.01■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 GRID1Q9ULK0 1009 aa20.01■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 E5RI56 91 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 CCDC166P0CW27 439 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 ADARP55265 1226 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 GCNT7Q6ZNI0 430 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 VRK3Q8IV63 474 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 DTX3LQ8TDB6 740 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 TEX101Q9BY14 249 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 EMCNQ9ULC0 261 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 PPP2R2AP63151 447 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 ITIH4Q14624 930 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 ZSCAN26Q16670 478 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 C1orf210Q8IVY1 113 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 FOXJ1Q92949 421 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 FAM111AQ96PZ2 611 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 TTC1Q99614 292 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 APOOQ9BUR5 198 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 TRIM39Q9HCM9 518 aa20■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 COPEO14579 308 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 TDGF1P13385 188 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 ATP5DP30049 168 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 CCNFP41002 786 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 KCNC1P48547 511 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 LDLRAP1Q5SW96 308 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 MACC1Q6ZN28 852 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 NLRP8Q86W28 1048 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 TMEM145Q8NBT3 493 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 HEXDCQ8WVB3 486 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 MOCOSQ96EN8 888 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 ACSS2Q9NR19 701 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 IGSF5Q9NSI5 407 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 TAS2R13Q9NYV9 303 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 GNPTGQ9UJJ9 305 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 LILRB5O75023 590 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 NDUFS2O75306 463 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 OXTRP30559 389 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 ACSBG2Q5FVE4 666 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 CLEC14AQ86T13 490 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 KCNJ9Q92806 393 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 APOPT1Q96IL0 206 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 HSPA12BQ96MM6 686 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 SLC6A18Q96N87 628 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 GPR78Q96P69 363 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 SLC23A2Q9UGH3 650 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 TLK1Q9UKI8 766 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 ACOT9Q9Y305 439 aa19.99■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 KRT87PA6NCN2 255 aa19.98■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 PFDN6O15212 129 aa19.98■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 LAMTOR5O43504 91 aa19.98■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 TSPAN12O95859 305 aa19.98■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 CHN1P15882 459 aa19.98■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 WDR4P57081 412 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
TMCO3-201ENST00000375391 HSPA14Q0VDF9 509 aa19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms