RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 FAM210AQ96ND0 272 aa23.64■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 KCNA7Q96RP8 456 aa23.64■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 DERL2Q9GZP9 239 aa23.64■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 MUC3BQ9H195 1237 aa23.64■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 HIPK3Q9H422 1215 aa23.64■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 RHBDL2Q9NX52 303 aa23.64■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 TAS2R13Q9NYV9 303 aa23.64■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 CDH7Q9ULB5 785 aa23.64■■□□□ 1.38
AMIGO1-201ENST00000369862 C2orf81A6NN90 581 aa23.64■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 ACOX3O15254 700 aa23.64■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 SNAP91O60641 907 aa23.64■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 PLD1Q13393 1074 aa23.64■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 FBXO48Q5FWF7 155 aa23.64■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa23.64■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 IGSF21Q96ID5 467 aa23.64■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC30A3Q99726 388 aa23.64■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 FKBPLQ9UIM3 349 aa23.64■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 LCHNA4D1U4 455 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 KERAO60938 352 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 NDUFS3O75489 264 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CHRM3P20309 590 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 TTKP33981 857 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 TRAF2Q12933 501 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF461Q8TAF7 563 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM125Q96AQ2 219 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 GPR21Q99679 349 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 SYTL2Q9HCH5 934 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD66B4E2M5 251 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 C9JVG2 144 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 ABLIM3O94929 683 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 LINC00032P0C843 101 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 LPOP22079 712 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 STT3AP46977 705 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 YBX1P67809 324 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 TSNQ15631 228 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPRNQ16849 979 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP51A1Q16850 503 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 DEFB115Q30KQ5 88 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 KIAA1841Q6NSI8 718 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CYGBQ8WWM9 190 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 GPR45Q9Y5Y3 372 aa23.63■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 A0A1W2PP18 115 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 SUPT3HB4E1H0 165 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CDC7O00311 574 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CLOCKO15516 846 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 OR1I1O60431 355 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 SUPT3HO75486 399 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 C1RP00736 705 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CTBSQ01459 385 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 LCP2Q13094 533 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 OGFOD2Q6N063 350 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 EFHBQ8N7U6 833 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 STAG3L4Q8TBR4 150 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 MIPOL1Q8TD10 442 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC68Q9H2F9 335 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 ALG2Q9H553 416 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 BPIFA1Q9NP55 256 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 SMPD4Q9NXE4 827 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 RNF112Q9ULX5 631 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 YIPF1Q9Y548 306 aa23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 ECI2O75521 394 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CXCL10P02778 98 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 MC4RP32245 332 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 RFC2P35250 354 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 GRIK2Q13002 908 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 SPATA19Q7Z5L4 167 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 HSPBAP1Q96EW2 488 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CXorf21Q9HAI6 301 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 BTRCQ9Y297 605 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 TCRBV5S2A0A599 114 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 KANSL1LA0AUZ9 987 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 INPP4BO15327 924 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 GNRH1P01148 92 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CES1P23141 567 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CAPGP40121 348 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 GSK3BP49841 420 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CLCQ05315 142 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 RAD51Q06609 339 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 ITFG2Q969R8 447 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 DOK1Q99704 481 aa23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
AMIGO1-201ENST00000369862 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms