RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364056.1

RNU6-960P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 960, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-960P, Length 120 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-960P-201ENST00000364056 KRT19P08727 400 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 DAOP14920 347 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 KCNA5P22460 613 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 KRT33BQ14525 404 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 GARNL3Q5VVW2 1013 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 OR7E24Q6IFN5 339 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 TRNP1Q6NT89 227 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM122CQ6P4D5 195 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM171BQ6P995 826 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 TMCO3Q6UWJ1 677 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 Q75L30 129 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 SFR1Q86XK3 245 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 DNAAF5Q86Y56 855 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 KMT5CQ86Y97 462 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 MCEMP1Q8IX19 187 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 PM20D2Q8IYS1 436 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 GBGT1Q8N5D6 347 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 GCSAMQ8N6F7 178 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 LSMEM1Q8N8F7 131 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 THAP6Q8TBB0 222 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 DNAAF4Q8WXU2 420 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 MOAP1Q96BY2 351 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 IL17FQ96PD4 163 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 SYT17Q9BSW7 474 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 APOL6Q9BWW8 343 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 KCNK15Q9H427 330 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 CD93Q9NPY3 652 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 POU2F3Q9UKI9 436 aa3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 OR5K3A6NET4 321 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZNHIT1O43257 154 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 KCNAB3O43448 404 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 WDR1O75083 606 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 CREG1O75629 220 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 GCNT3O95395 438 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 NR2F1P10589 423 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 DNASE1P24855 282 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 GABRA5P31644 462 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 CXCL9Q07325 125 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 TROAPQ12815 778 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 PRKAA1Q13131 559 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZNF234Q14588 700 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 MVPQ14764 893 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 ASIC2Q16515 512 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 GPR139Q6DWJ6 353 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 TEX38Q6PEX7 206 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 SPSB3Q6PJ21 355 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 TUBA1AQ71U36 451 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 DSG4Q86SJ6 1040 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 SLC9B2Q86UD5 537 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 ADIPOR2Q86V24 386 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 EPHX4Q8IUS5 362 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 FBXO39Q8N4B4 442 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 POC1AQ8NBT0 407 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 KCTD6Q8NC69 237 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 TAS1R2Q8TE23 839 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 SEMA4DQ92854 862 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 PHF21AQ96BD5 680 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 PTERQ96BW5 349 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 ERLEC1Q96DZ1 483 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 IGSF21Q96ID5 467 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 LMLNQ96KR4 655 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM81BQ96LP2 452 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 DUX5Q96PT3 197 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 MEIS3Q99687 375 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 TUBA1CQ9BQE3 449 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 RTN4RQ9BZR6 473 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 RETREG1Q9H6L5 497 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 SLA2Q9H6Q3 261 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 TRPC7Q9HCX4 862 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 PTTG2Q9NZH5 202 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 TTLL3Q9Y4R7 772 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 FAM169AQ9Y6X4 670 aa3.12□□□□□ -1.91
RNU6-960P-201ENST00000364056 PASKQ96RG2 1323 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms