RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360982.2

NCKAP1-201, Transcript of NCK associated protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NCKAP1, Length 4,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1-201ENST00000360982 PRRG4Q9BZD6 226 aa20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 COG5Q9UP83 839 aa20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 BBIP1A8MTZ0 92 aa20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 ECT2LQ008S8 904 aa20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 TRAF3Q13114 568 aa20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 TLR9Q9NR96 1032 aa20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 CNTN3Q9P232 1028 aa20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 ILVBLA1L0T0 632 aa20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 NELFEP18615 380 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 ALAS2P22557 587 aa20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 CRHR1P34998 444 aa20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 MED27Q6P2C8 311 aa20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 POC5Q8NA72 575 aa20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 OR7A2PQ8NGA2 310 aa20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 MARK4Q96L34 752 aa20.38■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 A0A1W2PQY0 241 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 SUV39H1O43463 412 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 NBNO60934 754 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 C8GP07360 202 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 ALOX5P09917 674 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 DGKEP52429 567 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 PYROXD2Q8N2H3 581 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 TMEM109Q9BVC6 243 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 LIMK2P53671 638 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 TIGD2Q4W5G0 525 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 C2orf27AQ580R0 203 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 C6orf89Q6UWU4 347 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 ATG14Q6ZNE5 492 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 ABCB10Q9NRK6 738 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 PSMD13Q9UNM6 376 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 WDR37Q9Y2I8 494 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 PI15O43692 258 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 TGDSO95455 350 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 HADHBP55084 474 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 ARHGAP8P85298 464 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 GPR33Q49SQ1 333 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 MINDY4Q4G0A6 757 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 UTS2BQ765I0 119 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 PIAS1O75925 651 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 XKR4Q5GH76 650 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 MSANTD2Q6P1R3 559 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 DAW1Q8N136 415 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 CLPTM1LQ96KA5 538 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 LMLNQ96KR4 655 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 ATG10Q9H0Y0 220 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 CLN6Q9NWW5 311 aa20.37■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 MCIDASD6RGH6 385 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 GPR17Q13304 367 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 RFX4Q33E94 735 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 SPESP1Q6UW49 350 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 OR4A15Q8NGL6 344 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 IPPKQ9H8X2 491 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 IGSF9Q9P2J2 1179 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 A0A1W2PPM1 405 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 GALNT18Q6P9A2 607 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 SAMD11Q96NU1 681 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 CREBZFQ9NS37 354 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 SALL4Q9UJQ4 1053 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 TCHHQ07283 1943 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 OR10H3O60404 316 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF846Q147U1 533 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 DPYSL2Q16555 572 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 MBLAC2Q68D91 279 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 SULT1C3Q6IMI6 304 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 AVL9Q8NBF6 648 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 SPOCK2Q92563 424 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 OSBPL2Q9H1P3 480 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 ABI3Q9P2A4 366 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF132P52740 706 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 SFRP1Q8N474 314 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 ZNF461Q8TAF7 563 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 C8orf48Q96LL4 319 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 BRINP2Q9C0B6 783 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 TTYH3Q9C0H2 523 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 ERVK-5Q9HDB9 667 aa20.36■□□□□ 0.85
NCKAP1-201ENST00000360982 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms