RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 FBXO48Q5FWF7 155 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 SPATA19Q7Z5L4 167 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 SPPL2CQ8IUH8 684 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 GOLM1Q8NBJ4 401 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 CCT7Q99832 543 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBED2Q9BTP6 218 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM15Q9C019 465 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 ACTR3BQ9P1U1 418 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 MYRFQ9Y2G1 1151 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 TIMM22Q9Y584 194 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 INSL5Q9Y5Q6 135 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD12Q6UB98 2062 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 SYCE1LA8MT33 242 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 STX16O14662 325 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 INSIG1O15503 277 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 TRMUO75648 421 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 C1RP00736 705 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 GABRR2P28476 465 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 GKP32189 559 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 MYLIPQ8WY64 445 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 RMDN1Q96DB5 314 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 RETREG1Q9H6L5 497 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 EGFL7Q9UHF1 273 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF225Q9UK10 706 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 CPQQ9Y646 472 aa18.57■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 DHRS12A0PJE2 317 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 TGM5O43548 720 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 KDELR3O43731 214 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 RHOCP08134 193 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 CDKN1CP49918 316 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 GRIK2Q13002 908 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIML2Q8N7C3 387 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC30A3Q99726 388 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 TM6SF2Q9BZW4 377 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PP18 115 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PRU2 124 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 PLOD2O00469 737 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 BNIP3LO60238 219 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 TBL1XO60907 577 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 FGF18O76093 207 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 CYBBP04839 570 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 CDK4P11802 303 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 NAA20P61599 178 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 TUBA4AP68366 448 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 INPP5AQ14642 412 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 PTPRNQ16849 979 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 TBCELQ5QJ74 424 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 GAREM2Q75VX8 874 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 SYVN1Q86TM6 617 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 TFAP2CQ92754 450 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 C11orf49Q9H6J7 331 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 BPIFA1Q9NP55 256 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 C2orf81A6NN90 581 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 A8MX80 341 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 ESRRBO95718 433 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 TSPAN12O95859 305 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 CKMP06732 381 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 SYN1P17600 705 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 AGTR2P50052 363 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 CDH4P55283 916 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 XKR7Q5GH72 579 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 PACRGLQ8N7B6 248 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM125Q96AQ2 219 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC45A3Q96JT2 553 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 CAAP1Q9H8G2 361 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 AIG1Q9NVV5 245 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 WBP1LQ9NX94 342 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 PCTPQ9UKL6 214 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 ASPDHA6ND91 283 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 CRCPO75575 148 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 OXCT1P55809 520 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 RCAN2Q14206 197 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 VEPH1Q14D04 833 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 KRT80Q6KB66 452 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 PIANPQ8IYJ0 282 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP1-201ENST00000357436 EFHBQ8N7U6 833 aa18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms