RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000352260.11

SPNS1-204, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,948 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-204ENST00000352260 RFPL2O75678 378 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 BMP2P12643 396 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 MYF6P23409 242 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 PKNOX1P55347 436 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 LMAN2Q12907 356 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 MAPRE2Q15555 327 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 MPP7Q5T2T1 576 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 GPR158Q5T848 1215 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 CHRDL2Q6WN34 429 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 SPRED2Q7Z698 418 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 SPNS2Q8IVW8 549 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 SPATA6LQ8N4H0 392 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 PBXIP1Q96AQ6 731 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 TCEAL4Q96EI5 215 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 TSPAN17Q96FV3 270 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 C17orf80Q9BSJ5 609 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 IGSF5Q9NSI5 407 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 CATSPERZQ9NTU4 200 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 SELENONQ9NZV5 590 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 XPR1Q9UBH6 696 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 CDYLQ9Y232 598 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 SZT2Q5T011 3432 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 A0A1B0GTW7 788 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 LINC01553A4QN01 128 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 K7ERQ8 282 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 MOSPD3O75425 235 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 CDH3P22223 829 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 PSMA3P25788 255 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 EPHA5P54756 1037 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 NRF1Q16656 503 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 MRNIPQ6NTE8 343 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 SLC15A3Q8IY34 581 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 CENPSQ8N2Z9 138 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 OR4L1Q8NH43 312 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 SH3RF2Q8TEC5 729 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 HEXDCQ8WVB3 486 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 ADGRE3Q9BY15 652 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 GID8Q9NWU2 228 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 EBF1Q9UH73 591 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 CCL26Q9Y258 94 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 VWA7Q9Y334 891 aa18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 ANKRD66B4E2M5 251 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 CFLARO15519 480 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 OGNP20774 298 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 DPP6P42658 865 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 LIPMQ5VYY2 423 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 OR4K2Q8NGD2 314 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 ATP6V1E2Q96A05 226 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 NEURL2Q9BR09 285 aa18.44■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 C2orf81A6NN90 581 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 SULT1C4O75897 302 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 PRSS56P0CW18 603 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 CD70P32970 193 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 IRS1P35568 1242 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 CDKN2DP55273 166 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 NME5P56597 212 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 STX5Q13190 355 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 CSHL1Q14406 222 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 TEAD2Q15562 447 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 FAM45BPQ6NSW5 357 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 RETSATQ6NUM9 610 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 TMEM53Q6P2H8 277 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 GOLM1Q8NBJ4 401 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 FIBINQ8TAL6 211 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 FAM45AQ8TCE6 357 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 CD320Q9NPF0 282 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 ARMC1Q9NVT9 282 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 PACSIN3Q9UKS6 424 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 CRYL1Q9Y2S2 319 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 GIPC1O14908 333 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 FZD6O60353 706 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 ARHGEF15O94989 841 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 FGF19O95750 216 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 SLC4A1P02730 911 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 PTPN2P17706 415 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 UBE3AQ05086 875 aa18.43■□□□□ 0.54
SPNS1-204ENST00000352260 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms