RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 CDH3P22223 829 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC11A1P49279 550 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 NR1D2Q14995 579 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 OLFML1Q6UWY5 402 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 PPM1MQ96MI6 270 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 S100A13Q99584 98 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CCSER2Q9H7U1 834 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CHRNA4P43681 627 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 BLKP51451 505 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CSNK2BP67870 215 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF461Q8TAF7 563 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 OLFM1Q99784 485 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 ADGRE2Q9UHX3 823 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 ERGIC3Q9Y282 383 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CLDN4O14493 209 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TM7SF2O76062 418 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 GNAZP19086 355 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 ITGAXP20702 1163 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CCNFP41002 786 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB30Q15771 203 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 AMIGO2Q86SJ2 522 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TEX47Q8TBZ9 253 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 DPEP2Q9H4A9 486 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 FSHRP23945 695 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC1A2P43004 574 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SEC13P55735 322 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TEAD4Q15561 434 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 MBLAC2Q68D91 279 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 IL12RB2Q99665 862 aa16.17■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 WNT9AO14904 365 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SIN3BO75182 1162 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 PRG2P13727 222 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 MAGEA11P43364 429 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 MAPK12P53778 367 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 AUTS2Q8WXX7 1259 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC47A1Q96FL8 570 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 NUAK2Q9H093 628 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 EXO5Q9H790 373 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 C8orf4Q9NR00 106 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 LGALS3BPQ08380 585 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 COX10Q12887 443 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM63BQ5T3F8 832 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TXNDC8Q6A555 127 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 FAAH2Q6GMR7 532 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 UNC5BQ8IZJ1 945 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC43A3Q8NBI5 491 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF671Q8TAW3 534 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SEC14L3Q9UDX4 400 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SQORQ9Y6N5 450 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAJA2O60884 412 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 HLA-DQB2P05538 268 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CLEC6AQ6EIG7 209 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 OSTM1Q86WC4 334 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TLCD1Q96CP7 247 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 DLG5Q8TDM6 1919 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CCDC162PA2VCL2 907 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 C9IYK1 514 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CAPN1P07384 714 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 XIAPP98170 497 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 BRAT1Q6PJG6 821 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 GDPD4Q6W3E5 623 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 HDDC3Q8N4P3 179 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 NAT8LQ8N9F0 302 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TSPAN14Q8NG11 270 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 MAT2BQ9NZL9 334 aa16.16■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TULP2O00295 520 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TAS2R41P59536 307 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC10A7Q0GE19 358 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 AMZ2Q86W34 360 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF540Q8NDQ6 660 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2AP1Q8NGE2 309 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 RACGAP1Q9H0H5 632 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 OR4F21O95013 312 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 MFN2O95140 757 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 GLYATQ6IB77 296 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 PQLC1Q8N2U9 271 aa16.15■□□□□ 0.18
SH3BP4-201ENST00000344528 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms