RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 EXT2Q93063 718 aa16.04■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 ABHD8Q96I13 439 aa16.04■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 APOL5Q9BWW9 433 aa16.04■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 SPATA16Q9BXB7 569 aa16.04■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 S1PR5Q9H228 398 aa16.04■□□□□ 0.16
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HPS1-202ENST00000338546 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 STK38LQ9Y2H1 464 aa16.04■□□□□ 0.16
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HPS1-202ENST00000338546 LAMP2P13473 410 aa16.04■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
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HPS1-202ENST00000338546 TTC23LQ6PF05 361 aa16.04■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 ZNF765Q7L2R6 523 aa16.04■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 NLRP8Q86W28 1048 aa16.04■□□□□ 0.16
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HPS1-202ENST00000338546 CLDN19Q8N6F1 224 aa16.04■□□□□ 0.16
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HPS1-202ENST00000338546 DCUN1D1Q96GG9 259 aa16.04■□□□□ 0.16
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HPS1-202ENST00000338546 ZNF385DQ9H6B1 395 aa16.04■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 PFDN4Q9NQP4 134 aa16.04■□□□□ 0.16
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HPS1-202ENST00000338546 CHSY3Q70JA7 882 aa16.03■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 FRA10AC1Q70Z53 315 aa16.03■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 SPNS2Q8IVW8 549 aa16.03■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 PARP9Q8IXQ6 854 aa16.03■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 DDHD1Q8NEL9 900 aa16.03■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa16.03■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 SUSD6Q92537 303 aa16.03■□□□□ 0.16
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HPS1-202ENST00000338546 CD274Q9NZQ7 290 aa16.03■□□□□ 0.16
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HPS1-202ENST00000338546 CEP290O15078 2479 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 VPS4BO75351 444 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 WFS1O76024 890 aa16.02■□□□□ 0.16
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HPS1-202ENST00000338546 ELFN1P0C7U0 828 aa16.02■□□□□ 0.16
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HPS1-202ENST00000338546 EZRP15311 586 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 HK3P52790 923 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 COPAP53621 1224 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 PKNOX1P55347 436 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 SH3BP2P78314 561 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 GBX1Q14549 363 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 PPP1R3AQ16821 1122 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 UGT3A2Q3SY77 523 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-202ENST00000338546 KANK2Q63ZY3 851 aa16.02■□□□□ 0.16
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