RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331559.9

MEIS3-201, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 2,104 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-201ENST00000331559 OR56A4Q8NGH8 313 aa22.96■■□□□ 1.27
MEIS3-201ENST00000331559 SLCO4A1Q96BD0 722 aa22.96■■□□□ 1.27
MEIS3-201ENST00000331559 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa22.96■■□□□ 1.27
MEIS3-201ENST00000331559 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
MEIS3-201ENST00000331559 TMEM181Q9P2C4 612 aa22.96■■□□□ 1.27
MEIS3-201ENST00000331559 GNPTGQ9UJJ9 305 aa22.96■■□□□ 1.27
MEIS3-201ENST00000331559 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.95■■□□□ 1.27
MEIS3-201ENST00000331559 A0A0U1RQS6 177 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 LBPP18428 481 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 CALRP27797 417 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 CD70P32970 193 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 HSPA13P48723 471 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 FOXA1P55317 472 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 FAM151BQ6UXP7 276 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 SERPINA9Q86WD7 417 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 FUNDC1Q8IVP5 155 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 AHI1Q8N157 1196 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 LRTOMTQ8WZ04 291 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 EPB41L1Q9H4G0 881 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 CD274Q9NZQ7 290 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 CROTQ9UKG9 612 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa22.95■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 GIPC1O14908 333 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 CLPTM1O96005 669 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 CHEK2O96017 543 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 GPX3P22352 226 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 GJA8P48165 433 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 KIF19Q2TAC6 998 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 C6orf10Q5SRN2 563 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 EME1Q96AY2 570 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 CORO1BQ9BR76 489 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 SLC39A3Q9BRY0 314 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 CLEC4EQ9ULY5 219 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 CSPG5O95196 566 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 ESRRBO95718 433 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 RPL5P46777 297 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 PTPN5P54829 565 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 CYP2R1Q6VVX0 501 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 SLC46A2Q9BY10 475 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 ASB8Q9H765 288 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 ZNF696Q9H7X3 374 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 TNFAIP8O95379 198 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 UROSP10746 265 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 HNF1BP35680 557 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 HK3P52790 923 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 NFATC2Q13469 925 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 NRF1Q16656 503 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 CDKN3Q16667 212 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 PITRM1Q5JRX3 1037 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 GRAMD4Q6IC98 578 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 IYDQ6PHW0 289 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 MIER2Q8N344 545 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 KLHL23Q8NBE8 558 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 TUBGCP3Q96CW5 907 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 LMLNQ96KR4 655 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 KCNA7Q96RP8 456 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 LYSMD1Q96S90 227 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 HGH1Q9BTY7 390 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 SLC2A11Q9BYW1 496 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 TUBB1Q9H4B7 451 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 COQ10BQ9H8M1 238 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 IL23AQ9NPF7 189 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 NDUFA13Q9P0J0 144 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 C7orf72A4D263 438 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 FGF19O95750 216 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 GLUD1P00367 558 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 LINC00271P0C7V0 271 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 GJA1P17302 382 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 SPAM1P38567 509 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 RGS4P49798 205 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 TGFBIQ15582 683 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 GPR33Q49SQ1 333 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-201ENST00000331559 FRA10AC1Q70Z53 315 aa22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms