RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000327307.11

RRN3-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3, Length 2,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-202ENST00000327307 DTX3Q8N9I9 347 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 MLKLQ8NB16 471 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 DAGLBQ8NCG7 672 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 LRRC46Q96FV0 321 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 FBXL20Q96IG2 436 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RANBP9Q96S59 729 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PTPN18Q99952 460 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CDT1Q9H211 546 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RGCCQ9H4X1 137 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 GRHL1Q9NZI5 618 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 COL20A1Q9P218 1284 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 KIF1AQ12756 1690 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 KNDC1Q76NI1 1749 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 OR2AG2A6NM03 316 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 LRRC53A6NM62 1247 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 OR52A4PA6NMU1 304 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 KCNJ18B7U540 433 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ZSCAN12O43309 604 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 JAK2O60674 1132 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PRPS1L1P21108 318 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 YWHABP31946 246 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 MC5RP33032 325 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 FEN1P39748 380 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 GATA4P43694 442 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PEX3P56589 373 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 RAB15P59190 212 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SNTA1Q13424 505 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.317e-9■□□□□ 8.8
RRN3-202ENST00000327307 MADCAM1Q13477 382 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 FGL2Q14314 439 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 KCNJ12Q14500 433 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 MTFR1Q15390 333 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SLFN12LQ6IEE8 588 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SPOPLQ6IQ16 392 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SERINC5Q86VE9 423 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ZFAND4Q86XD8 727 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 NME9Q86XW9 330 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 NRROSQ86YC3 692 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 BATF2Q8N1L9 274 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PSD4Q8NDX1 1056 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 NCOA7Q8NI08 942 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PYDC1Q8WXC3 89 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TRIB2Q92519 343 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SNX19Q92543 992 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 LPGAT1Q92604 370 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 LURAP1Q96LR2 239 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 MXRA8Q9BRK3 442 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 IDI2Q9BXS1 227 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 OSBPL8Q9BZF1 889 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 FOLH1BQ9HBA9 442 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 SETD4Q9NVD3 440 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 EXD2Q9NVH0 621 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PAG1Q9NWQ8 432 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 NCDNQ9UBB6 729 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 ADAM28Q9UKQ2 775 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 VPS4AQ9UN37 437 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 V9GYQ6 96 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TNS3Q68CZ2 1445 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 A0A0U1RQS6 177 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 STX16O14662 325 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TERTO14746 1132 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TNFRSF10CO14798 259 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 INPPL1O15357 1258 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 DHX15O43143 795 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 HBP1O60381 514 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 WFS1O76024 890 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3-202ENST00000327307 MBP02144 154 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.7 ms