RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291547.9

PKNOX1-201, Transcript of PBX/knotted 1 homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKNOX1, Length 5,003 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX1-201ENST00000291547 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa10.66□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 ELOVL7A1L3X0 281 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 TMEM221A6NGB7 291 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 URADA6NGE7 173 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 FADS2P1A8MWK0 482 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 IFI30P13284 250 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 ITIH1P19827 911 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 KLRC2P26717 231 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 CDK18Q07002 472 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 WSCD1Q658N2 575 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 DEFB128Q7Z7B8 93 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 OR52J3Q8NH60 311 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 XAGE5Q8WWM1 108 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 ZYG11BQ9C0D3 744 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 HSD3B7Q9H2F3 369 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 C3orf14Q9HBI5 128 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 DNAJC11Q9NVH1 559 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 UCKL1Q9NWZ5 548 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 MAFFQ9ULX9 164 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 ISM1B1AKI9 464 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 QSOX1O00391 747 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 FANCGO15287 622 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 TIE1P35590 1138 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 WNT3AP56704 352 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 DCDC1P59894 354 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 ZNF234Q14588 700 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 METTL21CQ5VZV1 264 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 KCTD8Q6ZWB6 473 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 PARGQ86W56 976 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 SPAG16Q8N0X2 631 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 SLC44A1Q8WWI5 657 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 SPOCK2Q92563 424 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 PMM1Q92871 262 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 BIRC8Q96P09 236 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 GAD1Q99259 594 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 COPS8Q99627 209 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 CHIAQ9BZP6 476 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 BRD9Q9H8M2 597 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 MYH3P11055 1940 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 CENPBD1B2RD01 187 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 PGLSO95336 258 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 ADRB2P07550 413 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 PTPRAP18433 802 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 CRHR1P34998 444 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 DEFA5Q01523 94 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 C9orf64Q5T6V5 341 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 C1orf189Q5VU69 101 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 FAM91A1Q658Y4 838 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 FAM35AQ86V20 835 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 RIOX2Q8IUF8 465 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 CRYBG2Q8N1P7 616 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 SNX33Q8WV41 574 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 LRTOMTQ8WZ04 291 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 SLC9A6Q92581 669 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 CNPPD1Q9BV87 410 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 ACSS2Q9NR19 701 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 FZD1Q9UP38 647 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 C10orf71Q711Q0 1435 aa10.65□□□□□ -0.7
PKNOX1-201ENST00000291547 H3BNH8 94 aa10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 NDUFS2O75306 463 aa10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 FABP3P05413 133 aa10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 TSPAN5P62079 268 aa10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 CDKL1Q00532 357 aa10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 NETO2Q8NC67 525 aa10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 CXorf40AQ8TE69 158 aa10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 C7orf43Q8WVR3 580 aa10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 ZFP3Q96NJ6 502 aa10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 KCNS3Q9BQ31 491 aa10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 CDADC1Q9BWV3 514 aa10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 ALG2Q9H553 416 aa10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 SEMA3GQ9NS98 782 aa10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 TRPS1Q9UHF7 1281 aa10.65□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 A0A075B6Q4 140 aa10.64□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa10.64□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 FABP12A6NFH5 140 aa10.64□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 CXCL11O14625 94 aa10.64□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 GIMD1P0DJR0 217 aa10.64□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 AXLP30530 894 aa10.64□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 SSR2P43308 183 aa10.64□□□□□ -0.71
PKNOX1-201ENST00000291547 MAGEA12P43365 314 aa10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.8 ms