RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261177.9

TSPAN11-201, Transcript of tetraspanin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TSPAN11, Length 5,505 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN11-201ENST00000261177 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.7□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 H0Y858 1186 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 UGT2B17O75795 530 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 FAM163BP0C2L3 166 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 ITPKAP23677 461 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 HNF4AP41235 474 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 PTGER3P43115 390 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 GMFBP60983 142 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 IL23RQ5VWK5 629 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 PPM1MQ96MI6 270 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 HAPLN3Q96S86 360 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 FPGTO14772 594 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 FABP3P05413 133 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 SLC18A1P54219 525 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 ABATP80404 500 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 PLET1Q6UQ28 207 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 DAW1Q8N136 415 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 UBR7Q8N806 425 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 CIB1Q99828 191 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 ALG2Q9H553 416 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 PRAMEF1O95521 474 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 RPL4P36578 427 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 SSR2P43308 183 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 TAS2R41P59536 307 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 FUT10Q6P4F1 479 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 NAT8LQ8N9F0 302 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 PEAK1Q9H792 1746 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 CLDN25C9JDP6 229 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 NDUFS2O75306 463 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 PRPS2P11908 318 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 IGFBP5P24593 272 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 MPP5Q8N3R9 675 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 LMAN2LQ9H0V9 348 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 TIMM22Q9Y584 194 aa14.69□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 ZNF541Q9H0D2 1346 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 WWP2O00308 870 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 RPIAP49247 311 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 PIH1D2Q8WWB5 315 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 RGS10O43665 173 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 KCNA10Q16322 511 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 GCNT6Q5T4J0 391 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 RNF44Q7L0R7 432 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 SVOPLQ8N434 492 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 ZNF384Q8TF68 577 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 SPACA7Q96KW9 195 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 FCRL5Q96RD9 977 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 GULP1Q9UBP9 304 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 PFDN2Q9UHV9 154 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 PRNPP04156 253 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 UGT2B4P06133 528 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 THRBP10828 461 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 CLEC6AQ6EIG7 209 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 TMPRSS11BQ86T26 416 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 FBXL18Q96ME1 805 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 IFNGP01579 166 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 DNTTP04053 509 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 NDUFV1P49821 464 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 MED22Q15528 200 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 RFWD3Q6PCD5 774 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 FAM131AQ6UXB0 335 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 SUN5Q8TC36 379 aa14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 MYBPHLA2RUH7 354 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 BCKDKO14874 412 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 CHPFQ8IZ52 775 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 ABCG8Q9H221 673 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 PLK2Q9NYY3 685 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 FBXL21Q9UKT6 434 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.67□□□□□ -0.06
TSPAN11-201ENST00000261177 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms