RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259607.6

CCL21-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 21, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL21, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL21-201ENST00000259607 ZMYND15Q9H091 742 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 LRRN3Q9H3W5 708 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 UGT1A7Q9HAW7 530 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 UGT1A10Q9HAW8 530 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 UGT1A8Q9HAW9 530 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 POT1Q9NUX5 634 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 KCNK4Q9NYG8 393 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 DKK4Q9UBT3 224 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 ASIC3Q9UHC3 531 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 PCYOX1Q9UHG3 505 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 PYCARDQ9ULZ3 195 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 KCNK6Q9Y257 313 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 TCAF1Q9Y4C2 921 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 RNF215Q9Y6U7 377 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 U3KQA8 63 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 BPTFQ12830 3046 aa10.14□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 SDR42E2A6NKP2 422 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 USP27XA6NNY8 438 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 CSO75390 466 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 POP7O75817 140 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 VIPP01282 170 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 PROS1P07225 676 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 SLC35G4P0C7Q5 338 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 OR56A5P0C7T3 313 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 ETS1P14921 441 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 XRCC1P18887 633 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 ETF1P62495 437 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 ACVR1Q04771 509 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 RPA4Q13156 261 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 SQSTM1Q13501 440 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 OLIG2Q13516 323 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 ISXQ2M1V0 245 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 FNBP1LQ5T0N5 605 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 FAM182AQ5T1J6 154 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 CASC4Q6P4E1 433 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 PACS1Q6VY07 963 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 MAATS1Q7Z4T9 603 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 SPRED1Q7Z699 444 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 HOOK3Q86VS8 718 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 SERPINA9Q86WD7 417 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 LRRC6Q86X45 466 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 LMNTD2Q8IXW0 634 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 PPIL6Q8IXY8 311 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 NAGSQ8N159 534 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 BBOF1Q8ND07 529 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 OR4L1Q8NH43 312 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 HM13Q8TCT9 377 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 CXorf40BQ96DE9 158 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 NAT9Q9BTE0 207 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 ARFGAP3Q9NP61 516 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 CPNE7Q9UBL6 633 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 TBC1D29Q9UFV1 150 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 PRKAB1Q9Y478 270 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 AK5Q9Y6K8 562 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 CCDC187A0A096LP49 1063 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 TRABD2BA6NFA1 517 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 D6RAR5 112 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 KPNA5O15131 536 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 MTX2O75431 263 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 ALDH4A1P30038 563 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 CCKBRP32239 447 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 PRLHRP49683 370 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 VPS41P49754 854 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 INHBCP55103 352 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 MAZP56270 477 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 DR1Q01658 176 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 PTK6Q13882 451 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 TUBB2AQ13885 445 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 KRT33BQ14525 404 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 KCNJ11Q14654 390 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 RTP5Q14D33 572 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 PERM1Q5SV97 790 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 METRNLQ641Q3 311 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 KCTD16Q68DU8 428 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 TTC27Q6P3X3 843 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 CYB5D1Q6P9G0 228 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 CREG2Q8IUH2 290 aa10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CCL21-201ENST00000259607 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.8 ms