RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257290.9

PDGFRA-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRA, Length 6,576 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRA-201ENST00000257290 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 CLUHO75153 1309 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 NARSO43776 548 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 AIREO43918 545 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 VPS4BO75351 444 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 RP2O75695 350 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 OLFM2O95897 454 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 DNTTP04053 509 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 LCN1P31025 176 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC1A3P43003 542 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 DCDC1P59894 354 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 RAB39AQ14964 217 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ATF7IP2Q5U623 682 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 FBXW5Q969U6 566 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 NODALQ96S42 347 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ACBD6Q9BR61 282 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 RSAD1Q9HA92 442 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 A0A1B0GVM2 712 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 BTBD17A6NE02 478 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 EFCAB7A8K855 629 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 B4GALT4O60513 344 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 RFPL1O75677 317 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 SLITRK5O94991 958 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC2A1P11166 492 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 GPR176Q14439 515 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 UGT3A2Q3SY77 523 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ANKRD40Q6AI12 368 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC25A25Q6KCM7 469 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 USP17L2Q6R6M4 530 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 BEX2Q9BXY8 128 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ANO3Q9BYT9 981 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 TAS2R7Q9NYW3 318 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 FEM1BQ9UK73 627 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 LRRC14BA6NHZ5 514 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 H3BNH8 94 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 PHYHO14832 338 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 SSX4O60224 188 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 SP4Q02446 784 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 DSC1Q08554 894 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 SREBF2Q12772 1141 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 GPS1Q13098 491 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 LAPTM5Q13571 262 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 FGFBP1Q14512 234 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 FAXCQ5TGI0 409 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 PACRGLQ8N7B6 248 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 SPATA22Q8NHS9 363 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC16A10Q8TF71 515 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 TSPEARQ8WU66 669 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 RCN3Q96D15 328 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 CYP26B1Q9NR63 512 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 RNF112Q9ULX5 631 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 UPK1BO75841 260 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ANXA3P12429 323 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 HMGCLP35914 325 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 CCR9P51686 369 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 NCS1P62166 190 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 MC2RQ01718 297 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 SYT16Q17RD7 645 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 COL28A1Q2UY09 1125 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 LEXMQ3ZCV2 418 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 SVBPQ8N300 66 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 SLC20A1Q8WUM9 679 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 TM9SF4Q92544 642 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 GPRASP2Q96D09 838 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 RHBGQ9H310 441 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDGFRA-201ENST00000257290 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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