RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 ITIH5Q86UX2 942 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 SNX19Q92543 992 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 TMBIM1Q969X1 311 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXO44Q9H4M3 255 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 GNPTGQ9UJJ9 305 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHB8Q9UN66 801 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 SOBPA7XYQ1 873 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 BTN3A1O00481 513 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 MGEA5O60502 916 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 THRBP10828 461 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMA3P25788 255 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 MGAT3Q09327 533 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 RBBP7Q16576 425 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 Q6ZSR9 355 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 DTWD1Q8N5C7 304 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 RAB2BQ8WUD1 216 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 RDH12Q96NR8 316 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 PDFQ9HBH1 243 aa21.9■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 B4GAT1O43505 415 aa21.89■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 TSPAN12O95859 305 aa21.89■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 SERPINF2P08697 491 aa21.89■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 EFEMP1Q12805 493 aa21.89■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAF2Q12933 501 aa21.89■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 FNDC5Q8NAU1 212 aa21.89■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 PIF1Q9H611 641 aa21.89■■□□□ 1.1
HTATSF1-201ENST00000218364 F8W810 466 aa21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 E2F3O00716 465 aa21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 ANXA6P08133 673 aa21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 PORP16435 677 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 PHEXP78562 749 aa21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 SDHAF4Q5VUM1 108 aa21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 THAP5Q7Z6K1 395 aa21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 C8orf48Q96LL4 319 aa21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF382Q96SR6 550 aa21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF711Q9Y462 761 aa21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 PLXNA3P51805 1871 aa21.89■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 NDUFS3O75489 264 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 TCF3P15923 654 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 GGT1P19440 569 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CD9P21926 228 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CRHBPP24387 322 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 MAPKAPK2P49137 400 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 HK3P52790 923 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CHPT1Q8WUD6 406 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 NRBF2Q96F24 287 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 PSME2Q9UL46 239 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 SPO11Q9Y5K1 396 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 ST14Q9Y5Y6 855 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A0U1RQF3 1178 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 OR4F21O95013 312 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 GSTM2P28161 218 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CCL14Q16627 93 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 ITFG1Q8TB96 612 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 ING2Q9H160 280 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 HPS4Q9NQG7 708 aa21.88■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 OR1E1P30953 314 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGEA8P43361 318 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 SELPLGQ14242 412 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 DDR2Q16832 855 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 AADATQ8N5Z0 425 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGED4Q96JG8 741 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 CGREF1Q99674 301 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 LHPPQ9H008 270 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 B3GNT3Q9Y2A9 372 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 COQ6Q9Y2Z9 468 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 BCL10O95999 233 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 OCM2P0CE71 109 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR15P49685 360 aa21.87■■□□□ 1.09
HTATSF1-201ENST00000218364 DSC3Q14574 896 aa21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70 ms