RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.252e-6■■■□□ 14.8
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CTDP1-201ENST00000075430 TMLHEQ9NVH6 421 aa16.58■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 GIN1Q9NXP7 522 aa16.58■□□□□ 0.24
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CTDP1-201ENST00000075430 KCNJ8Q15842 424 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 ZBTB6Q15916 424 aa16.57■□□□□ 0.24
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CTDP1-201ENST00000075430 E5RI56 91 aa16.57■□□□□ 0.24
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CTDP1-201ENST00000075430 GPIP06744 558 aa16.57■□□□□ 0.24
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CTDP1-201ENST00000075430 CD1DP15813 335 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 TTKP33981 857 aa16.57■□□□□ 0.24
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CTDP1-201ENST00000075430 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 EGFL8Q99944 293 aa16.57■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 ASPDHA6ND91 283 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 C16orf96A6NNT2 1141 aa16.56■□□□□ 0.24
CTDP1-201ENST00000075430 MFN2O95140 757 aa16.56■□□□□ 0.24
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CTDP1-201ENST00000075430 MYCP01106 439 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
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